ChemDraw 教程－3.doc

ChemDraw 教程－3 Written by Anan Wu Xiamen UniversityChapter 7 常用绘制技巧及其它功能 7.1 用快捷键标记原子 用ChemDraw快捷键可快速标记原子，原子所属官能团和提供原子的特性。文件CS ChemDraw HotKeys.txt位于\Program Files\CambridgeSoft\ChemOffice2004\ChemDraw\ChemDraw Items目录中，包含ChemDraw中提供的快捷键的定义。可以用文本编辑器编辑这个文件来增加或修改快捷键。 用快捷键编辑原子有以下描述的五种方法。 7.1.1 定位快捷标记原子 定位标记原子的方法： 绘制一化学结构。 将光标移动至原子点出定位，此时出现一蓝色亮斑。 按快捷键，标记将被添加到定位的原子处，如果标记为元素，那么系统将自动添加适当数目的H。见图7-1 图7-1 定位快捷标记原子 7.1.2 选择工具快捷变换原子 用选择工具变换标记原子的快捷方法： 绘制一化学结构。 用选择工具，然后将光标定位某原子，此时出现选择框。 按快捷键，将快捷变换成新标记的原子，如果标记为元素，那么系统将自动添加适当数目的H。见图7-2 图7-2 选择工具变换标记原子 7.1.3 标记被选择结构中的原子 标记被选结构中原子的快捷方法： 绘制一化学结构。 使用选择工具选择部分原子。 按快捷键（c），其连接键被全部选择的原子或官能团将被标记，快捷键所对应的元素或符号被加入到结构中。见图7-3 图7-3 选择部分原子 按快捷键C 7.1.4 运用默认的快捷键 在ChemDraw中设置了一些默认的快捷键，这些键不能在CS ChemDraw HotKeys.txt文件中编辑。默认的快捷键及操作功能如下： Enter 键：打开原子标记文本框。 Space：删除原子标记。 /键：当指向定位原子时，显示原子属性对话框。如果指向键，则打开键属性对话框。 =键：显示列举俗名对话框。 . 键：增加一个连接点。 7.1.5 快捷键效果 当在一个含有氮元素和氢组成的基团上加一个键时，氢原子的数目将自动增减以满足结构的正确性。例如，用CH2标记一个原子后，加入或删除一个键后氢原子数目的变化如下： 在丁烷的C3处，用快捷方式标记一个基团CH2。 用键工具或文字工具将鼠标定位在C3原子处，此时出现蓝色亮斑。 单击加入一个键，此时被标记的CH2基团会变为CH。 在3的基础上定位已添加的键并删除该键，标记的基团会由CH变回为CH2。 7.2 多中心结构和多连接标记 通过调整多中心连接可绘制有意义的络合物结构，例如，二茂铁[(Cp)2Fe]。绘制多中心连接结构的基本步骤是绘制结构的一个分子部分，通过选择和复制，建立其它分支部分，然后用键从络合配体的中心点（多中心节点）连接到中心原子上。因为用键连接的多中心节点不止一个，所以把键称之为多中心建，见图7-4。 图7-4 二茂铁多中心结构 7.2.1 多中心节点的建立 建立一个多中心节点的方法： 绘制一个要定义多中心节点的结构，例如：环戊二烯基。 从Structure菜单中选择Add Multi-Center Attachment。此时环戊二烯基中心显示一个星号，表示它有一个中心节点（图7-5）。 图7-5 环戊二烯有一个中心节点 7.2.2 多中心键的绘制 选择实键工具 指向环戊二烯的中心星号，单击或拖动鼠标建立一个单键。 在键的端点标记一个铁原子 注意：要使得二茂铁中的键看起来像从环中引出来的，应该选择单键后从Object菜单中选择Sent to Back命令。 一旦加了一个单键后，星号将会消失。但可利用键工具或者选择工具将鼠标移动至节点上检查星号是否依然存在。 重复上面操作可绘制出二茂铁的结构，见图7-4。 7.3 结构整理 利用Structure菜单中的Clean up Structure 命令和通过规范键长和角度可整理分子，使之得到规范化的结构。 如果只选择了部分原子，使用Clean up Structure 时其它原子和键将不受影响。 整理结构的方法： 用选择工具选择将整理的结构或者结构的一部分。 从Structure菜单中，选择Clean Up Structure命令，结构将被规范化。见图7-6 图7-6 整理前 应用Clean up Structure后 7.4 不定结构的绘制 利用Structure菜单中的Add Variable Attachment命令，可以绘制保持化学组成相同而结果不同的异构体。例如图7-7中所示的二溴基苯的三个异构体。 图7-7 二溴基苯的三个异构体