适于高梁dna指纹图谱库构建的核心ssr引物的确立determining.pdfVIP

分子植物育种(网络版), 2012 年, 第10 卷, 第1049-1060 页 Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1049-1060 http://mpb. 研究报告 A Letter 适于高梁DNA 指纹图谱库构建的核心SSR 引物的确立 1,2 2 3 3 1 2 王晶 , 张春宵 , 王凤华 , 郝彩环 , 杨德光 , 李晓辉 1 东北农业大学农学院, 哈尔滨, 150030 2 吉林省农业科学院生物技术研究中心, 长春, 130033 3 吉林省农业科学院/农业部植物新品种测试公主岭分中心, 公主岭, 136100 通讯作者: yangguang918@; lixiaohui2002lix@163.com; 作者 分子植物育种, 2012 年, 第10 卷, 第5 篇 doi: 10.5376/.2012.10.05 收稿日期：2011 年02 月10 日 接受日期：2012 年02 月27 日 发表日期：2012 年03 月6 日 这是一篇采用Creative Commons Attribution License 进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的 使用与传播。 建议最佳引用格式： 引用格式(中文) ： 王晶等, 2012, 适于高梁 DNA 指纹图谱库构建的核心 SSR 引物的确立, 分子植物育种(online) Vol.10 No.7 pp.1049-1060 (doi: 10.5376/mpb. cn.2012.10.0007) 引用格式(英文) ： Wang J., et al., 2012, Determining SSR core primers for establishing DNA fingerprinting profiles in Sorghum, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.7 pp.1049-1060 (doi: 10.5376/.2012.10.0007) 摘 要 本研究以 119 份高梁种质为试材，对搜集并合成的288 对高梁SSR 引物经过初筛、复筛和终筛，最终确立均匀分 布于高粱 10 个连锁群上的，扩增带型清晰、稳定且多态性水平高的41 对引物作为构建高梁DNA 指纹图谱数据库的核心引 物。这批引物既适用于变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测，又适用于高通量的DNA 测序仪检测。共检测出的总等位变异数为193， 每对引物检测出2~9 个等位基因，平均4.7 个；有效等位变异数在 1.1572~5.4690 之间，平均2.8146 ；Shannon-Weaver 指数 在0.262 0~1.881 3 之间，平均1.116 4 ；基因流在0.322 8~4.034 3 之间，平均1.034 4 ；Nei 期望杂合度在0.135 8~0.817 2 之 间，平均0.581 6 ；多态性信息量在0.135 9~0.817 1 之间，平均0.581 6 。这批引物用于高粱DNA 指纹图谱库构建是完全可 行的。本研究结果对于在分子水平上开展高梁品种鉴定、品种审定和品种权保护具有重要意义。 关键词 高梁；SSR；指纹图谱；核心引物 Determining SSR Core Primers for Establishing DNA Fingerprinting Profiles in Sorghum Wang Jing1,2 , Zhang Chunxiao2 , Wang Fenghua3 , Hao Caihuan3 , Yang Deguang1 , Li Xiaohui2 1 College of Agronomy, Northeast Agricultural University, Harbin, 150030 2 Center of Agri-Biot