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皂苷类似物与肾素的分子对接和结合能分析
张海玲 ， 光翠娥 ’， 江 泼 ， 汪俊卿 ， 桑 尚源
fI．食品科 微术嘲家 点 骑卒 l{_『久 ， 尤锡 2I4122；2．汀I{=大『学 生物 {程 院，汀苏 尢
214122 1
摘要：肾素是治疗高血压疾病的重要靶标之一，对 肾素抑制剂大豆皂苷 I及其类似物大豆皂苷
II、甘草皂苷、单葡萄糖醛酸甘草皂苷元与肾素进行分子对接 ，采用分子动力学模拟和MM—
PBSA相结合的方法计算对接复合物的结合 自由能，并且对各部分贡献能以及分子间相互作用
进行分析。结果表明范德华力和静 电相互作用是复合物形成的主要驱动力，S2和 S3是肾素和
皂苷相互作用重要的活性口袋，Ala229、Asp38,Asp226、Gly228和 Tyr83是 肾素 中与这类抑制剂
形成疏水作用的重要氨基酸残基 。Ser230、Tyr231、Ser84则可与抑制剂形成氢键 。对接结果与皂
苷抑制能力吻合性较好 ，可为新的肾素抑制剂的发现奠定基础。
关键词 ：肾素；大豆皂苷 I；分子对接 ；动力学模拟 ；结合 自由能
中图分类号：Q71 文献标志码 ：A 文章编号：1673—1689(2014)10—1056—07
M olecularDockingofSaponinAnalogueswithReninand
TheAnalysisofBindingEnergy
ZHANGHailing， GUANG Cuie ， JIANGBo， WANGJunqing2， SANGShangyuan
(1．StateKey1．aboratoryofFoodScience Technology，JiangnanUniversity，Wuxi214122，China；2．Sch(,olof
Biotechnology，JiangnanUniversity，Wuxi214122，China)
Abstract：Reninisoneofimportanttargetsforthetreatmentofhypertension．SoyasaponinIandits
analoguessoyasaponinII，glycyrrhizinandmonoglucuronylglycyrrhetinic(MGGM)weredockedwith
renin，andbindingfreeenergywascalculatedusingmoleculardynamicssimulationandMM—PBSA
docking method．Contributions of various energy types and intermolecular interactions were
analyzed．Resultsshowed thatthevan derW aalsforceandelectrostaticinteractionwerethemain
drivingforceandpocketsS2andS3wereprimarilyinvolvedinthebinding．Ala229．Val136．Ala317
andMet303werethekeyresiduesforthehydrophobiceffectandSer230，Tyr231andSer84were
criticalaminoacidsresponsiblefortheofrmationofhydrogenbonds．Dockingresultsareinwell
accordancewithinhibitionability，whichcanberegardedasthefoundationofrthediscovmy ofnew
rennininhibitors．
Keywords：renin，soyasaponinI，moleculardocking，dynanficssimulation，bindingfreeenergy
收稿 日期 ：20l4—03一l4
基金项 目：闻家r1然科学 金项rj(3l20l289)；食r科学 技术同家重点实验窜 自由探索 题(SKIF-ZZB一201208)．．
通信作者：光翠娥(】976～)，女，湖北仙桃人 ，r学博 f‘，剐教授 ，主要从事食 营养与功能闪子研究 。E—mail：guangl226@botmail．COl”
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