非小细胞肺癌mRNA的表达谱分析.PDFVIP

　 临床肿瘤学杂志２０１４年９月第 １９卷第９期　 Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｏｎｃｏｌｏｇｙ，Ｓｅｐ． ２０１４，Ｖｏｌ．１９，Ｎｏ．９　 ·７６９ · ·论　 　 著 · 非小细胞肺癌ｍＲＮＡ 的表达谱分析∗ ２１０００２　 南京　 南京大学医学院临床学院 南京军区南京总医院呼吸内科 王　 丽， 施雪霏， 袁冬梅， 杨　 雯， 陈　 子， 刘春花， 宋　 勇１ 　 　 【摘　 要】　 目的　 检测非小细胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）组织和正常肺组织中ｍＲＮＡ 的表达差异，并进行生物信息学分析。 方法 　 采用基因芯片技术对３例ＮＳＣＬＣ组织和３例正常肺组织的ｍＲＮＡ进行检测，筛选差异表达基因，进一步对差异表达基因进 行Ｇｅｎｅ Ｏｎｔｏｌｏｔｙ（ＧＯ）分析和信号通路分析。 结果　 在２０７１６条目的基因中共发现两种组织差异表达基因８９６条，其中５９３条 基因表达增加，３０３条基因表达降低；生物信息学分析表明上述差异性表达的ｍＲＮＡ参与了ＮＳＣＬＣ重要的生物学调节功能和 通路。 结论　 基因芯片技术可以筛选出ＮＳＣＬＣ组织和正常肺组织间差异表达的基因，ｍＲＮＡ在ＮＳＣＬＣ组织和正常肺组织间 的表达水平有明显差异，差异性表达的ｍＲＮＡ参与了ＮＳＣＬＣ重要的生物学功能。 　 　 【关键词】　 非小细胞肺癌；　 ｍＲＮＡ；　 芯片分析；　 基因表达谱 － － － 中图分类号：Ｒ７３４２　 　 文献标识码：Ａ　 　 文章编号：１００９ ０４６０（２０１４）０９ ０７６９ ０５ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｍＲＮＡ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｐｒｏｆｉｌｅｓ ｉｎ ｎｏｎ⁃ｓｍａｌｌ ｃｅｌｌ ｌｕｎｇ ｃａｎｃｅｒ 　 　 ＷＡＮＧＬｉ，ＳＨＩ Ｘｕｅｆｅｉ，ＹＵＡＮ Ｄｏｎｇｍｅｉ，ＹＡＮＧ Ｗｅｎ，ＣＨＥＮ Ｚｉ，ＬＩＵ Ｃｈｕｎｈｕａ，ＳＯＮＧ Ｙｏｎｇ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，Ｎａｎｊｉｎｇ Ｇｅｎｅｒａｌ Ｈｏｓｐｉｔａｌ ｏｆ Ｎａｎｊｉｎｇ Ｃｏｍｍａｎｄ， Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ ｔｈｅ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｎａｎｊｉｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｎａｎｊｉｎｇ ２１０００２，Ｃｈｉｎａ 　 　 Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇ ａｕｔｈｏｒ：ＳＯＮＧ Ｙｏｎｇ，Ｅ⁃ｍａｉｌ：ｙｏｎｇ＿ｓｏｎｇ６３１０＠ｙａｈｏｏ．ｃｏｍ 　 　 【Ａｂｓｔｒａｃｔ】　 Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ　 Ｔｏ ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅ ｔｈｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｐｒｏｆｉｌｅｓ ｏｆ ｍＲＮＡ ｂｅｔｗｅｅｎ ｎｏｎ⁃ｓｍａｌｌ ｃｅｌｌ ｌｕｎｇ ｃａｎｃｅｒ（ＮＳＣＬＣ） ｔｉｓｓｕｅｓ ａｎｄ ｎｏｒｍａｌ ｌｕｎｇ ｔｉｓｓｕｅｓ，ａｎｄ ａｎａｌｙｚｅ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ． Ｍｅｔｈｏｄｓ　 Ｇｅｎｅ ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ ｗａｓ ｕｓｅｄ ｔｏ ｅｘｐｌｏｒｅ ｍＲＮＡ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｐｒｏｆｉｌｅ ｉｎ ３ ｃａｓｅｓ ｏｆ ＮＳＣＬＣｔｉｓｓｕｅｓ（ＮＳＣＬＣｇｒｏｕｐ） ａｎｄ ３ｎｏｒｍａｌ ｌｕｎｇ ｔｉｓｓｕｅｓ（ｎｏｒｍａｌ ｇｒｏｕｐ）．Ｔｈｅ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ｇｅｎｅｓｗｅｒｅ ｓｅｌｅｃｔｅｄ ａｎｄ Ｇｅｎｅ Ｏｎｔｏｌｏｔｙ（ＧＯ） ａｎａｌｙｓｉｓｗａｓｐｅｒｆｏｒｍｅｄ ａｓｗｅｌｌ ａｓｐａｔｈｗａｙ ａｎａｌｙｓｉｓ． Ｒｅｓｕｌｔｓ　 Ａｍｏｎｇ２０７１６ｇｅｎｅｓ，８９６ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉ⁃ ａｌｌｙ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ｍＲＮＡｓｗｅｒｅｆｏｕｎｄ，５９３ ｍＲＮＡｓｗｅｒｅ ｕｐｒｅｇｕｌａｔｅｄ ａｎｄ ３０３ｍＲＮＡｓｗｅｒｅ ｄｏｗｎｒｅｇｕｌａｔｅｄ ｉｎ ｔｈｅ ＮＳＣＬＣｇｒｏｕｐ ｃｏｍｐａｒｅｄ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ｎｏｒｍａｌｇｒｏｕｐ，ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．ＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｒｅｖｅａｌｅｄｔｈａｔｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｍＲＮ