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海绵和海鞘中可培养放线菌的分离与多样性比较-海洋科学
海绵和海鞘中可培养放线菌的分离与多样性比较
1,3,4 2 3,4 1 1,2,3,4
杨 琪 , 信艳娟 , Christopher FRANCO , 柯才焕 , 张 卫
(1. , 361005; 2.
, 116023; 3. Flinders Centre for Marine Bioproducts Development; 4. Department of Medical Bio-
technology, School of Medicine, Flinders University, Adelaide, South Australia, 5042, Australia)
摘要: 在相同的分离培养条件下, 为比较地域差别较大的福建海域海绵动物( 山海绵Mycale sp.和网架
海绵Stylissa sp.)和海南海域海鞘动物(皱瘤海鞘Styela plicata 和乳突皮海鞘Molgula manhattensis)之间
可培养放线菌多样性的差异, 作者采用 5 种放线菌分离培养基和 1 种细菌通用培养基, 对海绵和海鞘
中的放线菌进行分离培养。采用 16S rRNA 基因限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length
Polymorphism, RFLP)分析和序列分析, 揭示其多样性。共获得可培养放线菌 198 株, 其中从海绵中分
离到87 株放线菌, 从海鞘中分离到 111 株放线菌。RFLP 分析表现为38 种不同的图谱类型。16S rRNA
基因序列分析表明, 从海绵中分离到的放线菌包括6 个放线菌属, 其中有2 株菌的 16S rRNA 基因序列
与最相近的菌株相似性低于97%, 可能是潜在的新菌株; 从海鞘中分离到的放线菌包括 7 个放线菌属,
有 8 株可能是潜在的新菌株。比较海绵和海鞘中可培养放线菌的多样性发现, 从海绵中分离到的放线
菌, 除节细菌(Arthrobacter ) 以外, 均包括在海鞘分离的放线菌属中。海鞘相关放线菌多样性水平不容忽
视, 是除海绵之外另一获得新型放线菌资源以及药用天然活性产物的重要来源。
关键词: 山海绵(Mycale sp.); 皱瘤海鞘(Styela plicata); 放线菌; RFLP; 16S rRNA 基因
中图分类号: Q939 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2013)07-0053-10
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