6天龄与10天龄大鼠的睾丸组织的基因差异表达.pdfVIP

基因组学与应用生物学，2012年，第 3l卷，第 1期，第 40—44页 GenomicsandAppliedBiology,2012，Vol-31，No．1，40—44 研究报告 ResearchReport 6天龄与 1O天龄大鼠的睾丸组织的基因差异表达 刘陶迪 。 罗奋华 - 于泊洋 吴应积 1内蒙古大学，哺乳动物生殖生物学与生物技术教育部重点实验室，呼和浩特，010021；2内蒙古医学院，基础医学院 呼和浩特，010050 ， 通讯作者。yingji _ wu@yahoo．com 摘 要 通过基因芯片技术，利用 Roche—NimbleGen公司制作的大 鼠12~135K全基因组表达谱芯片，对 日 龄为 6d和 10d的大 鼠睾丸组织进行全基因组表达差异分析 。结果显示：具有 2倍 以上的差异表达基因有 4298个，其 中表达上调的基因共 1878个，表达下调的基因共 2420个 。这些差异表达的基因中有 3154个 基因具有基因本体注释，参与了 154个生物学通路 。进一步分析表明具有 8倍以上差异表达的基因有 13个，这 些基因参与了生物学过程、细胞组分和分子功能等基因本体分类，进一步选择 3个差异表达 的基因， LOC686076、Cxcl6和 Trib3，做了实时定量RT—PCR检测。其结果趋势与芯片数据一致。因此，我们初步认为 精原干细胞的发生与增殖在大鼠早期的发育过程中已经有大量的基因参与，是一个多基因协调表达的过程。 关键词 大 鼠，睾丸组织，精原干细胞，差异表达，基因芯片 DifferentialGeneExpressionofRatTesticle’STissuesintheAgeof6and 10Days LiuTaodi。 LuoFenhua YuBoyang WuYingji 1KeyLaboratoryofMammalReproductiveBiologyandBiotechnology，MinistryofEducation，InnerMongoliaUniversity，Hohhot，010021；2Basic MedicalCollege，lnnerMongoliaMedicalCollege，Hohhot，010050 Correspondingauthor，yingiiwu@yahoo．com DO1：10．3969／gab．031．000040 Abstract Inthisresearch，differentialanalysisofgenome—wideexpressionoftherattestistissuesintheageof6 and 10dayswasconductedbygenechiptechnologybasedonthe12x135K genome—wideESTmicroarrayofrat producedbyRoche—NimbleGen．Theresultsshowedthattherewere4298geneswith2-foldormoredifferentially expressedintherattestistissuesbetweentheagesof6and10days，thereinto，1878geneswereup—regulated expressionand2420genesweredown-reug latedexpression．3154genesofthesedifferentiallyexpressedgenes havebeenannotatedwithgeneontoloyg ，participatinginthe154biologicalpathways．Furtheranalysisshowedthat therewere13geneswithmorethan8folddifferentialexpression，thosegenesinvolvedingeneontoloyg categories， suchasbiologicalprocesses，cellularcomponentsandmolecularfunctionsandSOon．Threedifferentiallyexpressed genes，LOC686076，Cxcl6andTrib3，werechosentodetectbyreal—timequantitativeRT—