猪源大肠杆菌 O157:H7与 O157的差异蛋白质组学分析研究.pdfVIP

猪源大肠杆菌 O157:H7与 O157的差异蛋白质组学分析研究.pdf

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基因组学与应用生物学,2012年,第 31卷,第6期,第 53卜537页 GenomicsandAppliedBiology,2012,Vo1.31,No.6,531—537 研究论文 ResearchArticle 猪源大肠杆菌O157:H7与O157的差异蛋白质组学分析 谢宇舟 密克 李军 陈泽祥 许力干 杨威 闭炳芬 榻雄标 潘艳 胡帅 广西兽医研究所,广西畜禽疫苗新技术重点实验室,南宁,530001 通讯作者,xjszexiang@163.tom 摘 要 为了阐述 O157:H7与 O157的致病力差异与蛋白质表达差异之间的关系,我们利用双 向电泳技术 和质谱技术对大肠杆菌两类菌株之间进行蛋 白质组学差异分析。菌体蛋 白经双 向电泳技术分离后,利用软件 ImageMasterMT2DPlatinum7.0对所得双 向电泳 图谱进行差异分析并借助质谱技术对差异蛋 白质点进行鉴 定,获得了背景清晰、分辨率高、重复性好的菌体总蛋白的双向电泳图谱 。两样品图谱差异分析结果表明,共 确定了28个有效的蛋 白质差异点(Av.ratio2.0,ANOVA0.05),经质谱鉴定将这 28个差异点注释成 23种 蛋白质。对得到注释的23种蛋 白质进行功能分类,发现 7类蛋 白质与致病性密切相关,即溶菌酶抑制剂、通 用应激蛋 白、LuxS、鞭毛蛋 白以及 3种外膜蛋 白。本结果将为进一步研究O157:H7菌株 的致病 因子,探究 O157:H7与其它大肠杆菌菌株的致病力差异,以及建立快速鉴别诊断O157:H7的试剂盒提供重要的依据。 关键词 大肠杆菌,肠出血性大肠杆菌,O157:H7,O157,蛋 白质组学,差异表达 DifferentialProteom icAnalysisbetweenEscherichiacoliIsolatesO157:H7 andO157from Swine XieYuzhou MiKe LiJun ChenZexiang XuLigan YangW ei BiBingfen XuanXiongbiao PanYan HuShuai GuangxiVeterinaryResearchInstitute,GuangxiKeyLaboratoryofAnimalVaccinesandNewTechnology,Nanning,530001 Correspondingauthor,xjszexiang@163.com DOI:10.3969/gab.031.000531 Abstract DifferentialproteomicanalysisbetweenE.colstrains0l57:H7andO157wascarriedout,inorderto clarifytherelationshipbetweenvirulenceanddifferentiallyexpressedproteinsofdifferentE.colistrains.Two— dimensiona1electrophoresisr2一DE)wasusedtoseparatebacterialproteinsandImageMasterMT2DPlatinum 7.0 softwareperfcIrmedvariation analysisoftheobtained 2D maDS.The differentially expressedproteinswere identifiedbymassspectrometry.The2D mapsofbacterialtotalproteinwithclearbackground,highresolutionand goodreproducibilitywereobtained.Thevariation analysisofwto sampleswasperformed andatotalOf28 differentiallyexpressedproteinspots(byfliterAv.ratio2.0andANOVA0.05)weredetected.Theseproteinspots were identified as23uniqueprotein rgoupsbymassspectrometry .The functionalclassification ofannotated proteinsindicatedthatsevenkindsofproteinswerecloselyrelatedtobacterialviurlenceincludingC—lysozyme inhibitor。universa

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