Transcriptome Analysis of Pacific White Shrimp （Litopenaeus vannamei）Hepatopancreas in Response toTaura Syndrome Virus （TSV） Experimental Infection.pdf

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2018-01-02 发布于广东
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Transcriptome Analysis of Pacific White Shrimp （Litopenaeus vannamei）Hepatopancreas in Response toTaura Syndrome Virus （TSV） Experimental Infection.pdf

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4 广西水产科技优秀论文文摘 TranscriptomeAnalysisofPacificWhiteShrimp (Litopenaeusvannamei) HepatopancreasinResponse toTauraSyndromeVirus(TSV)ExperimentalInfection DigangZeng XiuliChen，DaxiangXie，YongzhenZhao，ChunlingYang，YongmeiLi NingMa，MinPeng， QiongYang，ZhenpingLiao，HuiWang，XiaohanChert Guangx KeyLaboratoryofAquaticGeneticBreedingandHealthyAquaculture GuangxiInstituteofFisheries，Nanning，China E—mail：gxnnscs@126．com Abstract Background：ThePacificwhiteshrimp，Litopenaeusvannamei，isaworldwideculturedCFLIS— taceanspecieswithimpoAantcommercialvalue．Overthelasttwodecades，Taurasyndromevirus (TSV)hasseriouslythreatenedtheshrimpaquacultureindustryintheWesternHemisphere．To betterunderstandtheinteractionbetweenshrimpimmuneandTSV，weperformedatranscriptome analysisinthehepatopancreasofL．vannameichallengedwithTSV，usingthe454pyrosequencing (Roche)technology． Methodoloyg ／PrincipalFindings：Weobtained126919and102181high—qualityreadsfrom TSV～infectedandnon—infected (contro1)L．vannameicDNAlibraries，respectively．Theoverallde novoassemblyofcDNA sequencedatagenerated15004unigenes，withanaveragelengthof507 bp．BasedonBLASTX search (E—value，1025)againstNR，Swissprot，GO，COG andKEGG databases，10425unigenes (69．50％ofallunigenes)wereannotatedwithgenedescriptions，gene ontoloyg temr s，ormetabolicpathways．Inaddition，weidentified770microsatellitesanddesigned 497setsofprimers．Comparativegenomicanalysisrevealedthat1311genesdifferentiallyex— pressedintheinfectedshrimpcomparedtothecontrols，including559up—and752down—regu— latedgenes．Amongthedifferentiallyexpressedgenes，severalareinvolvedinvariousanimalim— munefunctions，suchasantiviral，antimicrobial，proteases，proteaseinhibitors，singaltransduction， transcriptionalcontrol，celldeathandcelladhesion． Conclusions／Significance：Thisstudyprovidesvaluableinfo