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对嗜压蛋白氨基酸压力不对称指数的修订.PDF
第 卷 第 期 华 侨 大 学 学 报 (自然 科 学 版 )
33 1 Vol.33 No.1
年 月 ( )
2012 1 JournalofHuaiaoUniversit NaturalScience Jan.2012
q y
文章编号: ( )
10005013201201004407
对嗜压蛋白氨基酸压力不对称指数的修订
张光亚
(华侨大学 化工学院,福建 厦门 361021)
摘要: 选取嗜压菌最多的 种希瓦氏菌属( )微生物共计 对同源蛋白,统计了 个氨基
4 犛犺犲狑犪狀犲犾犾犪 473 21662
酸突变位点,在此基础上计算氨基酸压力不对称指数( ),并将其同氨基酸 种理化性质进行相关性分
PAI 70
析.结果表明:色氨酸和异亮氨酸的嗜压性能最强,而脯氨酸、甘氨酸和天冬酰胺的嗜压性能最弱,这与之前的
报道存在较大差异 此外, 种氨基酸理化性质中有 种同 存在较强的相关性,其中仅有氨基酸的无
. 70 13 PAI
规则倾向因子同 呈负相关,表明高的 值不易形成卷曲 由于展示的 值更适合于处于低温环境
PAI PAI . PAI
下的嗜压微生物,因此对以前的PAI值进行了修正 .
关键词: 嗜压微生物;压力不对称指数;氨基酸;倾向因子;适压机制
中图分类号: Q936 文献标志码: A
对多数海洋微生物尤其是深海微生物而言,在高压下生存尤为重要,相比于其他极端微生物,人们
[]
1
对嗜压微生物的关注较少 同温度一样,压力也是严重影响生物体内分子体系的热动力学参数,但压
.
[]
2
力对生物分子的影响一直没有得到应有的重视 近年来研究发现,一些蛋白质(或者酶)在高压条件下
.
表现出良好的特性,如在最适温度下,生物分子的催化能力明显上升,酶活力提高了约 25%,或者其催
[ ]
34
化底物的特异性发生改变 ? .基因组学和蛋白质组学的迅猛发展,为了解嗜压微生物内生物分子体系
提供了全新的视角 通过对一些已完成基因组测序的嗜压微生物基因组或蛋白质组的分析表明,它们在
.
[]
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