稻纵卷叶螟线粒体基因组及细胞色素C氧化酶基因分析研究.pdfVIP

四川动物 2013年 第 32卷 第 1期 SichuanJournalofZoology Vo1．32 No．1 2013 DOI：10．3969／j．issn．1000—7083．2013．01．008 稻纵卷叶螟线粒体基 因组及细胞色素 C氧化酶基因分析 ， 尹溺华，司胜娟 ，涂飞云，张修月，岳碧松 (四川大学生命科学学院，成都 610064) 摘要：线粒体基因是研究生物系统进化的重要分子标记，本文对迁飞昆虫稻纵卷叶螟 Cnaphalocrocismedinalis 线粒体 DNA进行扩增及注释，结果表明：稻纵卷叶螟线粒体基因组全长 15377bp，AT含量为82％，基因组结构为 鳞翅 目所特有的CR—M．I．Q结构。以细胞色素 C氧化酶基因(COX)为分子标记，对有翅类昆虫22个物种进行系统 树构建，发现与昆虫翅的发生高度吻合。对存在于PCGs终止密码子判定的争议予以阐明并提出注释建议，有利于 今后动物线粒体基因组序列注释的统一规范。 关键词：稻纵卷叶螟 ；线粒体基因组；细胞色素C氧化酶基因；终止密码子注释；系统进化 中图分类号：Q966 文献标识码 ：A 文章编号：1000—7083(2013)O1—0040—04 A CompleteM itochondrialGenomeofCnaphalocrocismedinalis (Lepidoptera：Crambidae)anditsCoXGeneAnalysis YINYong-hua，SISheng-juan，TUFei—yun，ZHANGXiu—yue，YUEBi—song (CollegeofLifeSciences，SichuanUniversity，Chengdu610064，China) Abstract：Mitochondrialgenesrepresentimportantmolecularclocksforphylogeneticanalysis．Inpresentstudy，thecom— pletemitochondrial genomeofCnaphalocrocismedinaliswassequenced，whichisacircularmoleculewith 15377bplength (AT82％)．Thegenomestructureshowsalepidopteron—uniqueCR—M—I—Qarrangement．BasedonCOXgene，wespecula— tedphylogeneticrelationshipamong22pterygotan insectsspecies．Theresultsuggeststheevolutionofinsectswashighlyre— latedtothedivergenceoftheirwings．Threetypesofmodelareproposedofrthefirsttime，todeterminetheterminationco— donoftheanimalmtDNAs． Keywords：Cnaphalocrocismedinalis；mitoehondrial genome；COX gene；terminationcodon；phylogeneticanalysis 线粒体基因在过去的二十年中逐渐被作为一个 翅 目线粒体基因组具有 昆虫纲中所独有的CR—M—I— 中性的分子标记 ，广泛地应用于系统进化及种群遗 Q结构，这些都为引物设计、PCR扩增及扩增产物测 传学的研究 (Sheneta1．，2009)。线粒体是真核细胞 序带来了困难 ，因此，核酸数据库(GenBank)中记录 主要的供能器官，并拥有一套独立于细胞核的遗传 的鳞翅 目昆虫线粒体基因组全序列并不多。 系统。其中，细胞色素 C氧化酶基因(COX)作为细 稻纵卷 叶螟 Cnaphalocrocismed