基于RAPD标记的5个南京椴居群遗传多样性分析.pdfVIP

基于RAPD标记的5个南京椴居群遗传多样性分析.pdf

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植物资源与环境学报 2013,22(3):70—74 JournalofPlantResourcesandEnvironment 基于 RAPD标记的5个南京椴居群遗传多样性分析 汤诗杰 ,郑玉红 ,汤庚国 [1.江苏省 ·中国科学院植物研究所(南京中山植物园),江苏 南京210014;2.南京林业大学森林资源与环境学院,江苏 南京210037] 摘要:采用RAPD标记技术,对分布于江苏省 (紫金山、牛首山和宝华山)及安徽省(皇藏峪和琅琊山)的5个南京 椴(TiliamiquelianaMaxim.)居群的遗传多样性进行了分析,并采用UPGMA聚类方法研究了5个居群的遗传关系。 结果表明:使用 10条多态性引物从5个居群的总DNA中扩增出169条带 ,其中多态性条带 l5l条,多态性条带百 分率达89.34%。各居群的多态性条带百分率(PPB)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样度 (h)和Shannon’s多 样性指数 (,)均有明显差异,其中,宝华山居群的各项指标均最高,紫金山和牛首山居群的PPB值最低 ,琅琊山居群 的 值最低,紫金山居群的h和 ,值均最低。5个居群的,、h和舭 值分别为0.2430~0.3351、0.1544~0.2182 和 1.2489~1.3627;在种水平上的 ,、h和 ,ve值分别为0.3594、0.2236和 1.3529。居群 内变异 占总变异的 75.95%,居群间变异 占总变异的24.05%。居群内和居群间的基因多样度分别为0.2185和0.1732,物种水平上 的基因分化系数为0.2075,居群间的基因流为 1.9093。各居群问的遗传距离差异较大;其中,皇藏峪与牛首山居 群的遗传距离最近 ,仅为0.0265;宝华山与紫金山居群的遗传距离最远,为0.1344。通过聚类分析可将 5个南京 椴居群分为3支,宝华山和琅琊山居群各 自独立为2支 ,皇藏峪、紫金 山和牛首山居群聚为 1支,且可进一步分为 2个亚支,皇藏峪居群为 1个亚支、紫金山和牛首山居群聚为 1个亚支。研究结果表明:南京椴居群内的遗传多样 性较高,但居群内的变异 占主导地位,居群问存在明显的遗传分化。 关键词:南京椴;RAPD标记;居群变异;遗传多样性;基因分化;聚类分析 中图分类号:Q346.5;$792.36.01 文献标志码 :A 文章编号:1674—7895(2013)03—0070—05 DOI:10.3969/j.issn.1674—7895.2013.03.11 GeneticdiversityanalysisonfivepopulationsofTiliamiquelianabasedonRAPD marker TANG Shijie,ZHENGYuhong,TANGGengguo (1.InstituteofBotany,JiangsuProvinceandtheChinese AcademyofSciences,Nanjing210014,China;2.CollegeofForestResourcesandEnvironment, NanjingForestryUniversity,Nanjing210037,China),J.PlantResour.Environ.2013,22(3): 70—74 Abstract:Genetic diversity offive populations ofT/lia miqueliana Maxim. distributed in Jiangsu Province(BaohuashanMountain.ZiiinshanMountainandNiushoushanMountain)andAnhuiProvince (HuangcangyuandLangyashanMountain)wasanalyzedbyRAPD marker,andgeneticrelationship amongfivepopulationsalsowasstudiedbyUPGMA clustermethod.Resultsshow that169bandsare amplified from totalDNA offivepopulationsby 10 poly

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