基于AFLP标记的山东省5个野核桃群体的遗传多样性分析.pdfVIP

基于AFLP标记的山东省5个野核桃群体的遗传多样性分析.pdf

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植物资源与环境学报 2013,22(3):63—69 JournalofPlantResourcesandEnvironment 基于AFLP标记 的 山东省 5个野核桃群体的遗传多样性分析 王东升,辛 红,邢世岩①,刘晓静,吴岐奎 (山东农业大学林学院,山东 泰安 271018) 摘要:利用AFLP分子标记,对分布于山东省内5个样地 (泰山鹁鸽崖、鲁山核心区边缘 、崂山北九水、昆嵛山南天 门和泰山佛爷寺)的46个野核桃 (Jugla~cathayensisDode)单株的遗传多样性进行了分析 ,并采用聚类分析方法探 讨了它们的遗传关系。结果表明:用8对PstI/MseI系列引物组合从46个单株中共扩增出1034条带,其中多态性 条带 1005条 ,多态性条带百分率达97.20%;每对引物可扩增出113~154条多态性条带,平均每对引物可扩增出 125.6条多态性条带。在这些条带中包含 174条特异性条带 (其 中有 19条缺失条带),通过特异性条带可鉴别出 91.3%的野核桃单株。5个野核桃群体的多态性条带百分率 (PPB)、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数 (Ne)、 Nei’s基因多样度 (H)和Shannon’s信息指数 (,)分别为50.57%~63.51%、1.5057~1.6351、1.2735~1.3004、 0.1632—0.1819和0.249l~0.2813,PPB、Na、Ne、H和 ,的平均值分别为55.23%、1.5523、1.2843、0.1696和 0.2594,表明野核桃群体遗传多样性较高、遗传变异较为丰富。46个单株的遗传相似性系数为0.5368~0.8645, 平均值为0.6249。聚类分析结果显示:在遗传相似性系数0.66处,可将46个单株分成7组,其中部分来源于同一 产地的单株没有聚在同一组中,表明这些野核桃单株的遗传关系与其地理分布不完全一致。 关键词:野核桃;AFLP标记 ;遗传多样性;聚类分析;多态性条带 中图分类号:Q346.5;$792.13.01 文献标志码:A 文章编号:1674—7895(2013)03—0063—07 DOI:10.3969/i.issn.1674—7895.2013.03.10 Geneticdiversity analysison fivepopulationsofJuglanscathayensisfrom Shandong Province basedonAFLPmarker WANGDongsheng,XINHong,XINGShiyan ,LIUXiaojing,wUQikui (CollegeofForestry,ShandongAgriculturalUniversity,Tai’an271018,China),J.PlantResour. Environ.2013,22(3):63—69 Abstract:Thegeneticdiversityofforty—sixindividualsofJuglanscathayensisDodecollectedfrom five plots(i.e.BogeCliffofTaishanMountain.edgeofcorezoneofLushanMountain,BeijiushuiAreaof LaoshanMountain.NantianmenofKunyushanMountainandFoyeTempleofTaishanMountain)in ShandongProvincewasanalyzedbymeansofAFLP marker,andthegeneticrelationship amongthese individualsalso wasdiscussed by cluster analysismethod. Theresults show thatl034 bandsare amplifiedbyusingeightpairsofPstI/MseIprimercombinations,inwhich,thereare1005 polymorphic b

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