高分辨质谱技术视野下细胞代谢组学研究策略.PDF

· 1 · 生命的化学, 2014, 34(2): - 吴泽明, 等. 高分辨质谱w技w术w.视life野.a下c.c的n 细胞代谢组学研究策略 doi: 10.13488/j .smhx.201402 高分辨质谱技术视野下的细胞代谢组学研究策略 吴泽明，江峥，陈伟 (赛默飞世尔科技( 中国)有限公司，上海201206) 摘要：高分辨质谱技术的卓然发展，分析化学、化学计量学与生物学的深度融合，使得秉承系统性思 维、依托大数据信息表征能力的诸多组学技术在当今大行其道，让生命科学研究具备了愈加宏大开阔 Q Exactive / 的视野。以 为代表的高分辨率准确质谱同时定性与定量能力的坚实提升为细胞代谢组学研 究提供了系统完备的解决策略，从科学发现到假说验证，从非靶向全组分代谢信息表征到基于高分辨 定量的靶标代谢分析，高分辨质谱技术视野下的代谢组学思维将深切地改变着细胞研究的科研形态， 为生命科学打开一扇崭新的开启宝藏之门。 关键词：高分辨质谱；细胞代谢组学；代谢足迹；代谢指纹；Q-Exactive 1 细胞代谢组学的科学内涵与意义 位。在基于质谱技术的代谢组学研究中，依据实 验设计、分析手段与研究目标的不同而存在两种 细胞是生命活动的基本功能单位，对细胞表 实践模式：一是非靶向全组分代谢分析，二是靶 型特征的高效剖析是揭示生物现象的重要手段。 标代谢分析。 纵观近些年的生命科学研究，以诸多Omics组学技 术为主干的系统生物学可谓大放异彩、精妙纷 2 基于高分辨质谱的细胞代谢组学实践策略 呈。其中，代谢组学关注于定性定量地描述生物 2.1 非靶向全组分代谢分析 体系中小分子物质组在内外因刺激下诱导的生物 1 图 展示了完整的细胞代谢组学实践策略，非 化学变化。近些年来它的发展可谓蓬勃兴旺、一日 靶向全组分代谢分析的研究出发点是立足于对代 千里。通常，代谢组学可因研究对象的不同而细化 谢组的无区分、全息的化学表征，藉由深度信息 为诸多分支，以细胞为研究体系的细胞代谢组学也 对应和包含了两大范畴，即细胞代谢指纹分析与代 挖掘，寻找并鉴定有统计学差异的代谢组分，在 对其生物功能阐释后，揭示相关的生物调控机 谢足迹分析，其研究对象分别为胞内代谢组(endo- 制。非靶向全组分代谢分析是基于科学发现驱动 metabolome)与胞外代谢组(exo-metabolome)，两者 [1] 模式的研究，它的实施高度依赖于高分辨质谱技 一内一外，内外合一，具有高度的信息互补性 。 胞内代谢组是胞内复杂生化活动状态的高度概括 术同时定性与定量的信息表征能力。因此，它对 ( ) 性全息缩影，同时它还与胞外代谢组的分泌表达 质谱的分辨率、质量精度、谱图质量