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雨生红球藻铁型超氧化物酶基因的克隆与序列分析-海洋科学
雨生红球藻铁型超氧化物酶基因的克隆与序列分析
1 2, 3 2 1
樊寅卯 , 张 蕾 , 秦 松 , 严小军
(1. , 315211; 2.
, 264003; 3. , 100049)
摘要: 利用已报道的 FeSOD 保守区域, 设计简并引物, 通过简并 PCR 的方法获得了雨生红球藻
(Haematococcus pluvialis)FeSOD (HpFeSOD)cDNA 的部分序列, 然后采用RACE 方法分别克隆到 5′端和
3′端。拼接后得到 HpFeSOD cDNA 全长, 该基因全长为 1 138 bp, ORF 为 684 bp, 编码 227 个氨基酸。
把已经得到的 HpFeSOD 序列推导成氨基酸序列与一些已知物种的 FeSOD 氨基酸序列相比较, 雨生红
球藻 FeSOD 与杜氏藻、衣藻、团藻、石莼、颤藻的同源性为 89% 、83%、78% 、70%和 63% 。分子系
统学分析表明, 雨生红球藻FeSOD 与杜氏藻FeSOD 聚在一起, 介于真菌与高等植物之间并且真核微藻
FeSOD 与高等植物的同源性更高, 推测其在进化上与高等植物的亲源关系更近。
关键词: 雨生红球藻(Haematococcus pluvialis); 超氧化物歧化酶; 基因克隆; 序列分析
中图分类号: S335; Q785 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2012)04-0079-07
(superoxide dismutase, SOD) ()
, O–2 ,
O H O , O–2 , ,
2 2 2
3 SOD: MnSOD, Cu/ZnSOD , ,
FeSOD Cu/ZnSOD ; MnSOD [4] ,
; FeSOD ,
FeSOD MnSOD , ,
, Cu/ZnSOD ,
MnSOD FeSOD [1] FeSOD , ,
SOD, [5] FeSOD
SOD , , ,
FeSOD
FeSOD 1 材料与方法
FeSOD ,
1.1 材料
FeSOD , 1.1.1
[2] , FeSOD
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