13种鹭科Aves：Ardeidae鸟类系统关系及黄嘴白鹭遗传多样性的研究.pdf

摘要 摘要 本文分别通过线粒体的14个基因和粒体控制区5’端的DNA序列研究13种 鹭类(白鹭Egretta sacra、白脸 garzetta、黄嘴白鹭Eeu]ophotes、岩鹭E no 鹭E vaeho]landiae、苍鹭Ardea ibis、池鹭Ardeolabacchus、夜鹭Nycticorax sinensis、黑鸦上fla magnificus、黄苇璃[xobrychus vicollis和大麻鹏 Botaurus stellaris)的系统关系和黄嘴白鹭的遗传多样性。 rRNA基因到Cytb基因的DNA片段，序列长度在14737—14764bp之间，基因 排列顺序和已知的其他鸟类线粒体基因组的一致。结合来自GenBank的白脸鹭、 黑脸琵鹭P]atalea minor和朱鹗Nipponia 个蛋白编码基因的DNA序列分别进行比对后拼接用于系统关系分析。15种鸟类 为简约信息位点，平均转换和颠换分别为1186和463，R值为2．6。外群和内群 之间的未校正的遗传距离在0．153—0．166之间，内群中未校正的遗传距离在 0．018—0．139。 不同分析方法构建的系统树中，NJ树、ML树和BI树拓扑结构完全一致，13 种鹭科鸟类最早分化成两支，一支由大麻鹏、黑鸦和黄苇鹏组成，其中黑鹏和黄 苇鹏先聚在一起。剩下的10种鹭类组成另一支，其中池鹭最早分化出来独自形 成一个分支。海南璃、白脸鹭、白鹭、黄嘴白鹭和岩鹭聚成一个分支，其中黄嘴 白鹭和岩鹭先聚在一起，然后依次是白鹭、白脸鹭和海南鹏。夜鹭、牛背鹭、大 白鹭及苍鹭聚成一个分支，其中大白鹭和苍鹭先聚在一起，然后依次是牛背鹭和 夜鹭。 3种仲树中，非加权MP树和密码子第3位点赋权O．5的MP树拓扑结构一 致，和NJ树、ML树及BI树的差别是大白鹭和牛背鹭先聚在一起，然后才和苍 l 摘要 鹭形成姐妹群，而海南鹏则和池鹭聚在一起。第3位点转换和颠换赋权1：2．2 的肝树也是大白鹭和牛背鹭先聚在一起，但池鹭和其他两个分支是平行关系。 在黄嘴白鹭遗传多样性研究方面，以线粒体控制区DNA5’端433 bp长的DNA 序列进行分析，90个个体序列的比对结果共检测到30个变异位点，定义了31 种单倍型，其中3种为3个种群所共有，11种为两个种群所共有，17种为各个 平均为O．Olll。最简约网络图分析结果表明单倍型之间的关系和各自种群没有 明显的相关。 小菜屿、日屿和杏仁砣的单倍型多样性分别为0．860±0．057、0．878± 者之间单倍型多样性差异不大，但黄嘴白鹭3个种群的核苷酸多样性和核苷酸差 异均数显然都低于白鹭，最低的(小菜屿)都只有白鹭的52％左右，最高的(日 均表明黄嘴白鹭历史上曾发生过显著的种群扩张，时间约在13000至64000年前。 ofmolecular variance， 分子变异分析(analysis AMOVA)的结果表明， 黄嘴白鹭的遗传变异95％以上发生在种群内，种群间的遗传差异小于5％，但差 P0．01)。成对比较分析的结果表明小菜屿和杏仁砣的种群遗传分化显著 (distance—based Fst=0．0316， Fst= 0．0148，P0．05：haplotype—based 砣的种群只有在基于单倍型频率的分析方法中才显示遗传分化显著(Fst= 0．05)。