数量性状基因定位的回归方法.PDFVIP

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2018-01-06 发布于天津
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江苏农业研究/990218 江苏农业研究 JIANG SU AGRICULTURAL RESEARCH 1999年第20卷第2期Vol.20 No.2 1999 数量性状基因定位的回归方法 Ⅱ. 两侧标记回归分析莫惠栋 REGRESSION METHODS FOR LOCATING QUANTITATIVE TRAIT LOCUS (QTL) Ⅱ. FLANKING MARKER REGRESSION ANALYSIS Mo Huidong (Lab of Quantitative Genetics, Agric. Coll., Yangzhou Univ., Yangzhou 225009) 1　一般基础　　两侧标记回归是应用回归方法，搜索在染色体上的任何两个标记之间是否存在被研究的QTL及其最可能的位置和效应。它要解决的基本问题是： (1) 两个标记之间如果存在一个QTL，该QTL的位置和效应与个体或品系的表型值有什么遗传关系? (2) 如何发现此种关系?对于前一问题，关键是要导出三点重组率。设有 AQB 3个位点，AB的重组率为rAB, AQ、 QB的重组率分别为r 和r，如下图。则A和B未发生交换的概率(1- A B rAB)等于A和Q、Q和B均未发生交换的概率(1-r)(1-r)加上A和Q、 Q和B均发生交换的概率(rr)，即： A B A B 1-rAB=(1-r )(1-r)+rr A B A B 移项得： r AB=r +r-2rr • A B A B (1) 式(1)是三点重组率数量关系的基本公式，它的假定是区间AQ和QB的交换无干扰，即彼此独立。如果完全干扰，即AQ区间发生交换，QB区间就不能发生交换，反之亦然，则式(1)变为： r =r +r AB A B (2) 在缺乏完全干扰的确实证据时，一般都使用式(1)描述QTL在AB间的任一位置上的重组率。江苏农业研究/990218 1801.gif (1479 bytes) 　　对于后一问题，基本统计方法