临床基因扩增检验操作规范PPT.ppt

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临床基因扩增检验操作规范PPT

3、改进实验操作: (1) 带一次性手套; (2) 避免反应液的飞溅; (3) 用一次性移液器或吸头,吸头不要暴露于 空气,以免产物气溶胶污染; (4) 操作多份样品时,要先将可混匀的成分 (dNTPs,缓冲液,引物等)一起制备标准 混合液(Master mix); (5) 制备反应混合液时,最后加入样品DNA, 加入DNA后,在进行下一步操作前要盖紧 反应管。 4、检查结果的可重复性。 (二)污染源的追踪 1、阳、阴性对照 选择阳性对照时,应选择扩增弱, 且重复性好 的样品。 阴性对照的选择一定要小心。 不含模板DNA的PCR试剂对照。 2、常见的环境污染源有 (1) 点杂交的点样器; (2) 切片机; (3) 离心机; (4) 切胶用刀或微解剖刀; (5) 浓缩用具,真空瓶; (6) 电泳装置和紫外灯箱; (7) 干冰/乙醇或水溶锅; (8) 冰箱门把手、冷冻架和门把手。 追踪可疑的环境污染源 ① 用去离子浸湿的灭菌棉签擦试可疑部分 ② 在0.1ml 去离子水中浸泡; ③ 取5μl 作PCR反应; ④ 电泳检查结果。 (三)污染源的处理 1. 环境污染处理法 (1)稀酸处理法。 对擦试实验阳性部位或器件可用1mol/LHCl擦洗或浸泡残留DNA。 (2)紫外法: UV照射波长一般选择254/300nm,需考虑PCR产物的长度与产物序列中碱基的分布。UV对长片段(500bp以上)有效,而对短片段效果不大。 2. 反应液的污染处理法 (1) DNaseI法: PCR混合液(不加模板和Taq酶)中加入0.5U DNaseI,室温下作用30min后,加热灭活,加入模板和Taq酶后即可进行正常PCR。 优点:便宜,不需知道扩增DNA序列。 (2) 内切酶法: 选择识别四个碱基的内切酶(如MspI等),最好几种合用,可克服其识别序列特异的缺陷。方法同上,只是DnaseI由内切酶(MspI10U)代替,作用时间延长到1.0~1.5h。 (3) 紫外照射法: 反应中不加模板与Taq酶。 (4) 尿嘧啶DNA糖基化酶(UNG)法: dUTP代替反应中的dTTP,使产物中含大量dU,UNG可去除dU,使失去dU的位置,阻止Taq酶的延伸。PCR正常循环前,用UNG处理PCR反应混合液可消除PCR产物的污染,而UNG在正常PCR循环变性一步就会失活,所以,对含dU的新合成PCR产物没有影响 。 T A T A T A T A T A PCR A U A U A U UNG A A A 加热 A A A × PCR 该法优点: ① 去除任河来源(包括引物在内)的

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