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南湾猕猴mtDNA控制区变异及其种群遗传多样性
摘要
南湾猕猴mtDNA控制区变异及其种群遗传多样性
专 业:动物学
申请入:陶鑫
导 师:马广智 江海声
捅 晏
猕猴(Macacamulatta),又称恒河猴。现今猕猴已呈明显的岛
屿化分布,其生存受到威胁,被列为国家II级重点保护野生动物和野
生动植物种豳际贸易公约(CITES)附录ll。南湾猕猴分布在海南省
南湾半岛上,是与外界基本隔绝的一个猕猴种群,为了更为合理的保
护南湾猕猴种群,利用分子生物学技术对其遗传多样性进行了研究。
在南湾选取5个猴群(包括3个半驯化猴群和2个完全野生猴群),
探索采用非损伤取样法开展猕猴种群遗传多样性研究,共采集48个粪
便样晶,建立了粪样预处理、保存和分析方法。
在此基础上,选用mtDNA控制区和微卫星分子标记,对南湾猕
猴种群的遗传多样性进行比较分析,结果显示:
(1)在粪样品采集过程中,由于南湾植被为茂密的灌木丛林,仅
采用常规的跟踪取样法根本无法实现,本研究对跟踪取样法加以改进,
辅以食物引诱法,取得较好的效果。对于同一个体避免重复取样,是
通过区分猴群、个体年龄及性别,并且在同~时闻采集的粪便样品等
方式来排除重复取样。
区和选择l5对人的微卫星弓l物(经筛选适合非人灵长类)进行扩增,
控制区扩增长度约l000bp,其成功率达79.2%,处在可以接受的范围;
微卫星扩增成功率为l3.3%,是处在一今吃较低的水平,造成如此低
摘要
成功率的可能原因有:①核DNA的浓度较低;②引物的特异性不强。
(3)通过对40条南湾猕猴mtDNA控制区序列比对分析,发现仅
有1个多态信息位点,共定义了2种单倍型,核苷酸多样性为0.00026,
通过和其他的猕猴种群进行比较后发现,南湾猕猴种群遗传多样性处
在一个非常低的水平,微卫星的两个位点也表明南湾猴的遗传多样性
水平不高。
(4)通过比较发现,南湾猕猴遗传多样性如此低的原因可能是由
于在短期内发生过瓶颈效应的结果。
关键词:猕猴 线粒体控制区 微卫星 种群遗传多样性
II
Abstract
roI
111 ri aI DNAoont
ionof i tochond
vari at
Sequence
I ati 011 i0di versi tyofMacaca
i onand genet
reg popu
i 11Nanwan
mUlatta
Major:Zoology
Name:TaoXin
GuangzhiJiangHaisheng
Supervisor:Ma
ABSI RACI
Rhesus knownastheRhesus
mulatta),also
macaques(Macaca
of state
listedasa II the keyprotected
Monkey,is categoryspecies
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