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荔枝转录组文章案例 数据分析思路 基迪奥 培训组 广州基迪奥生物科技有限公司 广州大学城外环东路280号健康产业产学研孵化基地 020| service@ / • 荔枝叶组织转录组从头组装以及与活性氧（ROS ）反应 相关差异表达基因的鉴定 背景 圆锥花序叶原基 快速生长 正常气候 混合花蕾 正常开花 收获 （低温） 花蕾中早期叶 荔枝 脱离剥落 圆锥花序叶原基 荔枝 停止生长并萎缩 全球变暖 混合花蕾 抑制开花 产量 暖冬暖春 降低 花蕾中早期叶 生长为完全展开的叶片 甲基紫精（MV）产生的 活性氧（ROS）能促进早 期叶凋落、从而促进开花 研究目的： 了解荔枝花蕾发育背后的遗传学信息，阐明活性氧在荔枝开花过程中的分子 机制。 实验材料 如图A 中第3和第4处的早期 叶MV处理0小时，5小时， 10小时后，进行取样，6-10 个树枝混合叶作为一个样本， 在0h、5h、10h每个样本两 个重复。 趋势分析设计思路 组装注释 趋势分析 所有样本原 4 表格合并 始数据 差异基因并集 5 de novo 趋势分析 比对 有潜在生物学意 转录组 义的趋势 参考序列 功能富集分析 6 表达定量 目标挖掘 所有样本基 因表达量