基于web的食品微生物数据共享平台的设计与实现研究.pdfVIP

T技 术 S 。 —2012—NO．33 cienceand Technology nnovation Herald l 团■■一圆置■置狙f丘盥圈■z|I5薯 基T．-web的食品微生物数据共享平台的设计与实现①② 陈桥 张帆 喻峰 (北京中防昊通科技中心 北京 100013) 摘 要：本文阐述了我国食品微生物数据共享平台建设的现状和重要性，平台的设计思路和内部逻辑关系。系统充分利用了数据库技术及web 技术的优势，以国外知名的数据平台资源为基础，实现了食品微生物数据的查询、发布，浏览以及网络交互等功能。平台主要由数据检索子系统． 数据管理子系统．在线分析子系统等部分组成。 · 关键词：食品微生物检测 蛋白质指纹图谱 信息系统 网络数据库 中图分类号：TP3 文献标识码：A 文章编号：1674—098X(2012)11(c)一0043--03 近年来 ，全球多次出现微生物造成 的 据量非常大，没有专 门针对食品微生物进 点之一。我们通过与中科院生物所、军事科 食品污染问题 。据 中国疾控中心营养与食 行分类 ，对于使用者来说检索起来并不方 学院微生物流行病研究所等科研单位的合 品安全所对相关资料的分析，2006—2010 便。因此 ，平台的数据来源以国际知名的数 作 ，提出将基于MALDI-TOF MS(基质 年卫生部共收到食源性疾病暴发事件报告 据库为基础，结合食品检验检疫实际需要， 辅助激光解析电离飞行时间质谱)技术的 2023起，累计发病62920人，死亡967人 ，其 筛选 出行业 中常用数据并进行二次加工和 蛋白质指纹 图谱技术作为食品微生物检测 中微生物引起的食源性疾病暴发事件数和 分类 。这样在数据检索过程 中，就能有效 技术创新的切入点。 患者数最多，分别 占40．09％$N61．92％…。 减少使用者的查询时间，提高检索效率。 MALDI—TOF MS能够直接检测全菌 食源性微生物污染已成为威胁人民身体健 二、数据类型较为丰富。生物信息类网 或细胞裂解物，形成含有标志物分子量信 康的重要因素之一 ，需要引起全社会的高度 站缺乏微生物检测方面的数据，而一般微生 息的质谱图，将质量图谱预与已知图谱数据 重视 。 物类网站也没有生物信息方面的数据。这就 库 中的特征性质谱 图比对，从而实现鉴定 生物信息数据共享平 台作为一种重要 造成了使用者为了查找同一个微生物菌种的 。 但 目前质谱仪器种类繁多，产生的数据 的科技基础条件平台， 能够促进食品微生 不同数据，不得不在多个网站上中进行查找。 格式都不相同，分析软件无法互相兼容数 物检测行业更好的发展 ，国内外许多高校 因此，在数据库的建设过程中，应该尽量将相 据；数据分析方法也不尽相 同，需要 的数据 和实验室都建立了基于网络的生物信息学 关性较强的数据进行整合和关联，让用户能 格式繁多。这些因素给数据共享和交换带来 数据共享平台。基于此 ，我们提出，以生物 够在一个平台上能够方便地找到所有数据。 麻烦，不利于数据库的及时更新与补充，有 信息学技术为基础，构建食品微生物数据 三 、技术上具备一定的探索性和先进 必要对指纹图谱数据格式标准化问题进行 和 资源共享平台，探素食品微生物检测 的 性。传统的食品微生物检测方法耗时较长， 研究 先进技术 ，并将相关研究成果应用于国内 已经不能满足现在的实际需求 ，需要重 点 四、平台服务功能灵活，数据能够互通共 食 品微生物检验 、出入境食品和农产品微 发展快速检测技术。因此，本平台在设计之