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第2章 核酸的生物化学
第 2 章核酸的结构和功能 Structure and Function of Nucleic Acid 核酸的一级结构 定义 多核苷酸链中核苷酸的排列顺序。 由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列。 (一)DNA双螺旋结构的研究背景 碱基组成规律 Chargaff 规则: [A] = [T];[G] ? [C] (二) DNA双螺旋结构要点 1、DNA是反向平行、右手双螺旋的双链结构。 两条走向相反:一条为 3? → 5?;另一条为 5? → 3? 。 磷酸-戊糖骨架在螺旋外侧,碱基伸向内侧 2、 DNA双链间形成了互补碱基对 两条链间的碱基严格互补: A与T配对,形成两个氢键,G与C配对,形成三个氢键,称为碱基互补原则. 3、碱基堆积力和氢键共同维持DNA双螺旋结构的稳定. (三)DNA双螺旋结构的多样性 核小体串珠样结构 2、双链DNA的折叠组装 Introduction:Features of RNA Structure 1)通常以单股链存在,但可有局部二级或三 级结构 2)RNA分子比DNA分子小 3) RNA的种类与结构都比DNA复杂 一、mRNA( messenger RNA)是蛋白质合成的模板 mRNA由不均一核RNA(hnRNA)加工生成。故hnRNA是成熟mRNA的前体 二、真核mRNA的3′末端有一个多聚腺苷酸(polyA)结构 大多数真核mRNA的3′末端有一个多聚腺苷酸(polyA)结构,称为多聚A尾。 原核生物的mRNA没有这种首、尾结构 ( Transfer RNA,tRNA ) tRNA结构特点: 1、含有多种稀有碱基(rare bases) . 除A、G、C、U外的碱基,叫稀有碱基 如:双氢尿嘧啶(DHU),甲基化的A、G 次黄嘌呤(I), 假尿嘧啶核苷(ψ)等 2、tRNA具有茎环结构 tRNA单链可自身回折,形成局部双螺旋,叫茎环结构(stem-loop structure ,或发夹结构 hairpin structure)。 tRNA的二级结构:三叶草形 tRNA分子的三级结构:倒L形 3、tRNA的3′端连有氨基酸 所有tRNA的 3′端均有—CCA-OH的共同结构,是连接AA的位点。 4、 tRNA的密码子能识别mRNA的密码子 rRNA与Pr结合形成核蛋白体(核糖体),作为蛋白质合成的场所。 原核和真核生物的核糖体均由易于解聚的大、小亚基组成 热变性 解链曲线:如果在连续加热DNA的过程中以温度对A260(absorbance,A,A260代表溶液在260nm处的吸光率)值作图,所得的曲线称为解链曲线。 DNA的复性 核酸分子杂交的3种形式 DNA-DNA之间 RNA-RNA之间 DNA-RNA之间 第 五 节 核 酸 酶 Nuclease 三、DNA的复性与分子杂交 DNA复性(renaturation)的定义 在适当条件下,变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象,这一现象称为复性。 减色效应 DNA复性时,其溶液OD260降低。 热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,这一过程称为退火(annealing) 。 目 录 在DNA变性后的复性过程中,如果将不同种类的DNA单链分子或RNA分子放在同一溶液中,只要两种单链分子之间存在着一定程度的碱基配对关系,在适宜的条件(温度及离子强度)下,就可以在不同的分子间形成杂化双链(heteroduplex)。这种现象称为核酸分子杂交。 核酸分子杂交(hybridization) 第三节 RNA的结构与功能 Structure and Function of RNA RNA的种类、分布、功能 成熟mRNA结构示意图 稀有碱基 假尿嘧啶核苷的连接方式:C1’—C5 氨基酸连接位点 氨基酸臂 DHU环 反密码环 T?C环 反密码子 (Ribosome RNA, rRNA) * rRNA的种类(根据沉降系数) 真核生物 5S rRNA 28S rRNA 5.8S rRNA 18S rRNA 原核生物 5S rRNA 23S rRNA 16S rRNA 核蛋白体的组成 占总重量的35% 49种 占总重量的30% 31种 蛋白质 4718个核苷酸 160个核苷酸 120个核苷酸 28S 5.85S 5S 2940个核苷酸 120个核苷酸 23S 5S rRNA 60S 50S 大亚基 占总重量的50% 33种 占总重量的40% 21种 蛋白质 1874个核苷酸 18S 1542个核苷酸 16S rRNA 40S 30S 小亚基 真核生物(
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