化学生物学导论-蛋白质化学1-2 PPT.ppt

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化学生物学导论-蛋白质化学1-2 PPT

在多肽链中,氨基酸残基按一定的顺序排列,这种排列顺序称为氨基酸顺序; 氨基酸的顺序是从N-端的氨基酸残基开始,以C-端氨基酸残基为终点的排列顺序。 五肽形成 丝氨酰-缬氨酰-酪氨酰-天冬氨酰-谷酰胺或Ser-Val-Tyr-Asp-Gln N末端 C末端 牛核糖核酸酶 124个氨基酸 多肽是一个线性链状分子 肽链中的氨基酸不是原来完整的分子,多肽链中的氨基酸单位称为氨基酸残基。 肽键 链状结构 多肽命名 氨基末端 羧基末端 下列五肽命名为丙氨酰谷氨酰亮氨酰缬氨酰组氨酸: 返回 由一个氨基酸的?-羧基与另一个氨基酸的?-氨基脱水缩合而形成的化学键。 二、肽键(peptide bond) 在蛋白质或多肽的肽键中,氮原子上的孤对电子与羰基具有明显的共轭作用;组成肽键的原子处于同一平面; -C=O与-N-H之间呈反式面相互平行,很少扭曲。 肽键的特点 0.127nm 键长=0.132nm 0.148nm 肽键的部分双键性质 肽键的键长和键角 1925年Linus Pauling等对肽结晶中肽键各原子之间键长和键角的分析 肽键中的C-N键具有部分双键性质,不能自由旋转。 在大多数情况下,以反式结构存在。 甘氨酰丙氨酸 肽键的反式结构 返回 多肽的两性解离 多肽的水解 三、多肽的性质 多肽的两性解离:在pH0-14范围内,多肽分子中含有游离?-NH 2和游离?-COOH末端及侧链上可解离的基团 ; 多肽可以看成是一个“大氨基酸”,离解性质和氨基酸相似; 在水溶液中以两性离子形式存在,每一种肽都有其相应的等电点,计算方法与氨基酸一致且复杂; pI=(pK’2+ pK’3)/2 1、多肽的两性离解 在等电点时,正离子数目与负离子数目相等,净电荷为零; 等电点的高低,主要取决于侧链上碱性和酸性基团的相对数目 多肽的水溶液存在形式 多肽与溶液pH 值相关 当溶液pH值小于等电点时,多肽以正离子形式存在; 当溶液pH值大于等电点时,多肽以负离子形式存在; 当溶液pH值等于等电点时,多肽的溶解性最小,电泳时也不移动; 2、多肽链的水解 酸水解:常用6mol/L的盐酸或4mol/L硫酸在105-110℃条件下进行水解,反应时间约20h; 优点:不容易引起水解产物的消旋化;缺点:色氨酸被沸算完全破坏; 碱水解:一般用5mol/L的氢氧化钠煮沸10-20h;此法水解过程许多氨基酸都受到不同程度的破坏,产量太低。 酶水解:主要使用蛋白酶进行部分水解,如胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶及其羧肽酶氨肽酶。此法不会破坏氨基酸,也不会发生消旋化,水解产物为部分较小肽段。 返回 活性肽 生物的生长、发育、细胞分化、大脑活动、肿瘤病变、免疫防御、生殖控制、抗衰老、生物钟规律及分子进化等均涉及到活性肽。 生物活性肽是机体内传递信息、调节代谢和协调器官活动的重要化学信使。 天然存在的重要多肽 高等动物中枢神经系统产生的一类小活性肽。如 Met-脑啡肽和Leu-脑啡肽等。 +H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Met-COO- +H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-COO- 1、脑啡肽是一类重要的肽 天然存在的重要多肽 2. 多肽类激素及神经肽 促甲状腺素释放激素的N端残基是谷氨酸,此残基易于自身环化成焦谷氨酰基(α氨基与谷氨酸的γ羧基脱水缩和而成)。 天然存在的重要多肽 3、抗生素 抗革兰阴性杆菌抗生素, 具杀菌作用 具有表面活性剂的作用,能降低细菌细胞膜的表面张力,改变膜的通透性,甚至破坏膜 天然存在的重要多肽 4、激素 天然存在的重要多肽 天然存在的重要多肽 5、谷胱甘肽(glutathione, GSH)是体内重要的还原肽 谷胱甘肽的分子中有一个特殊的γ肽键,是由谷氨酸的γ羧基与半胱氨酸的α氨基缩合而成。由于GSH中含有一个活泼的巯基很容易氧化,二分子GSH脱氢以二硫键相连成氧化型的谷胱甘肽(GSSG)。 返回 五、多肽的化学合成 多肽的化学合成,是按照设计的氨基酸顺序,通过定向形成酰胺键方法得到目标多肽分子; 氨基酸之间形成酰胺键的反应相当复杂; 要成功的合成具有特定氨基酸顺序的多肽,必须采用定向形成酰胺键方法,即对暂时不参予形成酰胺键的氨基和羧基,以及侧链活性基团进行保护。同时还要对羧基进行活化。 (一)氨基酸常用的保护方法 保护基必须具备的条件 易在预定的部位引入,在接肽时能起保护作用; 在某特定的条件下,保护基很易除去; 引入和除去保护基时,分子中的其它部位 不会受到影响,特别是已接好的肽键。 1.氨基保护 2. 羧基保护 3. 侧链保护 4. 接肽方法 多肽合成必须解决下面四个问题 1、氨基的保护 常用氨基保护基的方法:酰化 最广泛应用的氨基保护基(PG)是叔丁氧甲酰基(t-

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