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枇杷属内栽培种和部分野生种ITS序列分析ITSsequences-广西植物
-
Guihaia - http:/ / www.guihaia journal.com
Nov.2017,37(11):1447 1454
DOI:10.11931/ guihaia.gxzw201706010
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引文格式:陈灼娟. 枇杷属内栽培种和部分野生种ITS序列分析 [J]. 广西植物,2017,37(11):1447 1454
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CHEN ZJ. ITS sequencesfrom cultivars and some wild species of genusEriobotrya [J]. Guihaia,2017,37(11):1447 1454
枇杷属内栽培种和部分野生种 ITS序列分析
陈灼娟
( 福州大学 至诚学院生物工程系,福州 350002 )
摘 要:对不同栽培区的25种普通枇杷品种以及7种枇杷属野生种的ITS序列进行扩增并测序,采用邻接
法和最大简约法进行系统发育树的构建并对枇杷属内不同种间的遗传关系进行了分析。 结果表明:枇杷属
+ +
植物ITS序列ITS1 5.8SrDNA ITS2总长度为592 bp或594 bp,长度变化发生在ITS2。 所有样本的ITS1和
5.8S rDNA长度一样,都是223bp和168bp;而ITS2为201bp或203bp。 5种枇杷属野生种的ITS序列长度
为594 bp,包括栎叶枇杷、大渡河枇杷、南亚枇杷、南亚枇杷窄叶变种和大瑶山枇杷;其余2种枇杷属野生种
(麻栗坡枇杷、小叶枇杷)和普通枇杷栽培种的ITS序列长度都为592 bp。 所有样本 ITS序列的GC含量为
64.2%~64.5%,其中ITS1为64.1%~65.5%,ITS2为68.1%~72.6%。 对所有样本的ITS序列比对产生44个
可变位点,其中38个为简约信息位点,其中11个位于ITS1,5个位于5.8S rDNA,22个位于ITS2。 最大的种
间序列差异为7.7%,最小的种间差异发生在麻栗坡枇杷和小叶枇杷之间,仅为0.2%。 普通枇杷种内的ITS
序列差异很低,25种普通枇杷栽培种之间的序列差异为0~1.5%。 所研究的枇杷属植物可分为3个分支。
分支 Ⅰ包括所有普通枇杷品种,分支Ⅱ包含5种野生枇杷种,包括栎叶枇杷、大渡河枇杷、南亚枇杷、南亚枇
杷窄叶变种和大瑶山枇杷;分支Ⅲ由2个野生枇杷种(麻栗坡枇杷、小叶枇杷)组成。 该研究结果表明ITS
序列对枇杷种间鉴定和系统发育分析具有一定意义,但对普通枇杷栽培种间的鉴定作用不大。
关键词:枇杷属,ITS序列,变异位点,系统发育
中图分类号:Q781,Q949 文献标识码:A 文章编号:1000⁃3142(2017)11⁃1447⁃08
ITS sequences from cultivars and some wild
species of genusEriobotrya
CHEN Zhuo⁃Juan
(Department of Biological Engineering,Zhicheng College,Fuzhou University,Fuzhou 350002,China )
Abstract:Internal transcribed spacer (ITS1,5.8S rDNA and ITS2) reg
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