抗生素生物合成基因簇克隆策略的研究进展-生物加工过程.PDFVIP

第 １４卷第２期 生　 物　 加　 工　 过　 程 Ｖｏｌ１４ Ｎｏ２ ２０１６年３月 ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｐｒｏｃｅｓｓ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ Ｍａｒ２０１６ － ｄｏｉ：１０３９６９／ ｊｉｓｓｎ１６７２ ３６７８２０１６０２０１３ 抗生素生物合成基因簇克隆策略的研究进展 １ １，２ １ 王婷婷 ，邓子新 ，陈文青 （１． 武汉大学 药学院 组合生物合成与新药发现教育部重点实验室，湖北 武汉 ４３００７２； ２． 上海交通大学 生命科学技术学院，上海 ２００２４０） 摘　 要：抗生素是一类具有多种生物活性的微生物次级代谢产物，自然界中６０％以上的抗生素由放线菌所产生。 克隆抗生素生物合成基因簇可为阐明其生物合成机制，结构改造，产量提高提供重要信息。 在后基因组时代，新的 抗生素基因簇克隆策略不断涌现，大大提高了微生物重要次级代谢产物生物合成基因簇的克隆效率，并缩短了抗 生素的发现周期。 本文综述了抗生素生物合成基因簇克隆策略的研究进展，包括近年来发展的后基因组的克隆 策略。 关键词：抗生素；次级代谢产物；生物合成基因簇；克隆策略；后基因组时代 － － － 中图分类号：Ｑ７８１　 　 　 　 文献标志码：Ａ　 　 　 　 文章编号：１６７２ ３６７８（２０１６）０２ ００７０ ０５ Ｐｒｏｇｒｅｓｓ ｉｎ ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ ｆｏｒ ｃｌｏｎｉｎｇ ｏｆ ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｔｉｃ ｇｅｎｅ ｃｌｕｓｔｅｒｓ １ １，２ １ ＷＡＮＧＴｉｎｇｔｉｎｇ ，ＤＥＮＧＺｉｘｉｎ ，ＣＨＥＮ Ｗｅｎｑｉｎｇ （１Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｃｏｍｂｉｎａｔｏｒｉａｌ Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｍｉｎｉｓｔｒｙ ｏｆ Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ， Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｗｕｈａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｗｕｈａｎ４３００７２，Ｃｈｉｎａ；２． Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ａｎｄ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， ＳｈａｎｇｈａｉＪｉａｏｔｏｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｓｈａｎｇｈａｉ ２００２４０，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ ａｒｅｍｉｃｒｏｂｉａｌｓｅｃｏｎｄａｒｙｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓｗｉｔｈｄｉｖｅｒｓｅｂｉｏａｃｔｉｖｉｔｉｅｓ，ａｎｄｍｏｒｅｔｈａｎ６０％ｏｆ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓａｒｅｐｒｏｄｕｃｅｄｂｙＡｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｓ． Ｃｌｏｎｉｎｇｏｆ ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓｂｉｏｓｙｎｔｈｅｔｉｃｇｅｎｅｃｌｕｓｔｅｒｓｏｆｆｅｒｓ ｐｉｖｏｔａｌ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｆｏｒ ｅｌｕｃｉｄａｔｉｎｇ ｔｈｅｉｒ ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｔｉｃ ｍｅｃｈａｎｉｓｍ，ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ｙｉｅｌｄ ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔ． Ｉｎ ｐｏｓｔ⁃ｇｅｎｏｍｉｃ ｅｒａ，ｔｈｅ ｅｆｆｉｃｉｅｎｃｙ ｆｏｒ ｔｈｅ ｃｌｏｎｉｎｇ ｏｆ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓ ｇｅｎｅ ｃｌｕｓｔｅｒｓ ｉｓ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ｅｎｈａｎｃｅｄ，ａｎｄ ｒｅｄｕｃｅｄ ｔｈｅ ｔｉｍｅ ｆｏｒ ｎｅｗ ａｎｔｉｂｉｏ