全基因组关联分析搜寻中国人群白癜风免疫相关基因Whole genome association analysis to search for immune related genes of vitiligo in Chinese population.pdfVIP

目 录 英文缩略词表 1  摘 要 2  正 文 8  1  前 言 8  1.1  研究背景 8  2  实验材料与方法 13  2.1  研究对象 13  2.2  实验试剂 13  2.2.1  DNA 提取试剂 13  2.2.2  RNA 提取 13  2.2.3  电泳用试剂 14  2.2.4  标准化 DNA 用试剂 14  2.2.5  基因分型用试剂 14  2.3  实验仪器 15  2.3.1  DNA 提取器材 15  2.3.2  电泳的仪器 16  2.3.3  测 OD 值仪器 16  2.3.4  基因分型仪器 17  2.4  实验方法 18  2.4.1  全血标本采集 18  2.4.2  基因组 DNA 提取 18  2.4.3  基因组 DNA 电泳 19  2.4.4  DNA 浓度标准化 20  2.4.5  Illunima Human 610-Quard 芯片全基因组基因分型 22  2.4.6  Sequenom MassArray 系统基因分型 29  2.5  数据质控和统计分析 39  2.5.1 数据质控 40  2.5.2 数据分析 40  3 结果 45  3.1 研究对象一般情况 45  3.2 全基因组 SNPs 分型数据的统计分析结果 45  3.3 非MHC 区域统计分析结果 48  3.4 表达谱芯片统计分析结果 48  4 讨论 56  4.1  白癜风全基因组关联分析研究的课题设计 56  4.2  白癜风新的易感位点 12q13， 57  4.3  白癜风新的易感位点 10q22 58  4.4  白癜风新的易感位点 11q23 58  4.5  验证白癜风全基因组关联分析已发现的位点 58  4.6  后期研究的展望 58  5 结论 60  参考文献 61  附 录 63