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4.蛋白质结构与功能-3
现代动物生物化学
蛋白质结构与功能的
现代概念
New Concepts of Protein
Structure and Functions
(3 )
蛋白质的有丰富的结构层次
相同氨基酸组成的肽链可能
形成不同的分子形态
三
百
个 胶
氨 原
基 蛋
酸 白
的
肽
链
可 胶原蛋白分子由三股左手螺旋组成。
能 每条链1000Aa,有20多种形式并由
的 各自的基因表达。一周螺旋3个Aa ,
分
为Gly-X-Y ,X常是Pro,Y常是Hpro,
子
还含有Hlys,并糖基化。
形
态 纤维相互之间通过Lys交联。
胶原纤维有I,II,III,V ,XI等
主要类型,是皮肤,骨骼等的重要成分。
单体
二聚体
原丝
初原纤维
角蛋白是构成毛发的纤维蛋白
注意Coiled coil 超螺旋结构中两条螺旋接触
部分氨基酸残基的疏水性
弹性蛋白 (Elastin ),可以伸展和复位,与胶原蛋白
有相似的性质,分子长度750Aa,高度疏水,富含Pro
和Gly,不糖基化,含Hpro,不含Hlys 。分子之间由
Lys交联。
结构域的功能
三磷酸甘油醛脱氢酶
分子的空间结构显示
两个结构域以及与底
物三磷酸甘油醛、Pi
以及NADH 的结合部
位。
注意这样的球状分子
表面有许多突然回折
(sharp turn ),使
蛋白质分子具有复杂
和精细的表面特性。
比较进化阔别亿万年的两种生物 (酵母与果蝇)的同源结
构域 (homeodomain )发现其一级结构变化了,但是构
象特征保留下来了,可见蛋白质的折叠形态是有限的。
结构域重组创造出蛋白质新的表面特征
由结构的同源性可以推测一个未知蛋白质的功能
上图中,DNA结合结构域 (兰色三角形)都出现在基因调节蛋白中
而与环核苷酸有关的结构域 (红色长方形)存在于一些信号通路上的
酶分子上
蛋白质分子构象的进化
一条多肽链,理论上可以形成数量巨大的、能量水平相当的
分子构象,但是被自然界接纳的只有少数。其余的大多是无
用的,甚至可能是有害的而被淘汰。
目前所知的蛋白质的多肽链都有精细的结构和空间折叠。这
赋予了它特殊的功能。
许多蛋白质家族 (family )具有共同的祖先基因。通过基因
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