第4讲 通径分析 群体与数量遗传学 教学课件.ppt

群体数量遗传学 第4讲 通径分析 通径分析 一、相关与回归 二、通径系数 三、亲属之间的遗传相关 举例：牛的体长、胸围和体重 一、相关与回归 1、简单相关（直线相关） 一、相关与回归 体长(X1) 胸围(X2) 体重(X3) 一、相关与回归 1、直线相关 2、偏相关 3、直线回归（简单回归） 体长(X1)与体重(Y) 胸围(X2)与体重(Y) 相关系数与回归系数的转化 数据的标准化 一、相关与回归 1、直线相关 2、偏相关 3、直线回归（简单回归） 3、偏回归(多元回归) 二、通径系数(P) 1、定义：通径系数是标准化的偏回归系数。 二、通径系数(P) 1、定义 2、通径系数系数有方向，没有单位 二、通径系数(P) 3、相关系数的分剖 二、通径系数(P) 4、决定系数 一个自变量到依变量的通径系数的平方称为该自变量对依变量的决定系数dy.x。 两自变量间的相关系数与它们各自到依变量的通径系数的乘积的2倍称为该两自变量对依变量的共同决定系数dy.x1x2 。 二、通径系数(P) 5、当自变量相互独立时，各自变量到依变量的通径系数等于两者之间的相关系数。 二、通径系数(P) 6、各自变量对依变量的决定系数与共同决定系数之和等于1。即 通径系数是标准化的偏回归系数。 二、通径系数(P) 7、当两个依变量为某些共同自变量的线性函数时，二者之间的相关系数等于连接它们的所有通径链的系数之和，而每个通径链的系数就等于该通径链的全部通径系数和相关系数的乘积。 二、通径系数(P) 8、通径链的追溯原则 通径的方向：只能先退后进，不能先进后退 二、通径系数(P) 8、通径链的追溯原则 通径的方向：只能先退后进，不能先进后退 只能改变一次方向 二、通径系数(P) 8、通径链的追溯原则 通径的方向：只能先退后进，不能先进后退 只能改变一次方向 相关线相当于尾端相连的通径 二、通径系数(P) 8、通径链的追溯原则 通径的方向：只能先退后进，不能先进后退 只能改变一次方向 相关线相当于尾端相连的通径 避免重复 举 例 Y是一个主要经济性状，影响它的主要有3个自变量性状，X1，X2，X3，他们的相关系数如下表； 请求出各自变量到Y的通径系数，并分析，X3对Y的直接和间接影响有多大？ 举例 Y1=X1+X2； Y2=X2+X3 rx1x30 ； rx1x2= rx2x3=0 用通径系数方法求证： 三、亲属之间的遗传相关 1、亲子间的通径关系 X(个体)＝g1(精子)＋g2(卵子) 三、亲属之间的遗传相关 1、亲子间的通径关系 合子到配子的通径系数b: 三、亲属之间的遗传相关 1、亲子间的通径关系 配子g’1到配子g1 （配子世代）的通径系数a’b: 三、亲属之间的遗传相关 1、亲子间的通径关系 合子X’到合子X(合子世代)的通径系数ba: 三、亲属之间的遗传相关 2、随机交配下亲属间的遗传相关r 亲子关系 r=1/2 三、亲属之间的遗传相关 2、随机交配下亲属间的遗传相关r 祖孙关系 r=(1/2)2=1/4 三、亲属之间的遗传相关 2、随机交配下亲属间的遗传相关r 半同胞关系 r=(1/2)2=1/4 三、亲属之间的遗传相关 2、随机交配下亲属间的遗传相关r 全同胞关系 r=2(1/2)2=1/2 三、亲属之间的遗传相关 2、随机交配下亲属间的遗传相关r 叔侄关系： r=2(1/2)3=1/4 三、亲属之间的遗传相关 2、随机交配下亲属间的遗传相关r 一代堂兄弟关系 ：r=2(1/2)4=1/8 三、亲属之间的遗传相关 2、随机交配下亲属间的遗传相关r 一代双兄弟关系： r=4(1/2)4=1/4 举例:婚姻法禁止直系血亲和三代以内的旁系血亲结婚.  作业 根据下列系谱,计算X与Y个体的遗传相关. y1 y2 x1 x2 x3 P1 P2 P’2 P3 P’3 P‘1 r12 y1 y2 x1 x2 x3 P1 P4 P’2 P3 P’3 x5 x4 P5 0.73 0.21 0.55 Y -0.16 -0.29 X3 -0.11 X2 X3 X2 X1 y1 -0.11 x1 x2 x3 P1 P2 -0.16 P3 -0.29 ryx1=0.55 ryx2=0.21 ryx3=0.73 应用相关系数的分剖法 y1 y2 x1 x2 x3 P1 P’2 P2 P3 x g1 g2 F a a x g’1 g’2 F’ a’ a’ b 配子到合子的通径系数a: x g1 g2 F a a X’ g’1 g’2 F’ a’ a’ b X’个体与其配子g1的相关＝ g’1配子与X’个体的相关 r X’ g1= r X’ g’1 b=a’+a’F’ x g1 g2 F a a X’ g’1 g’2