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用BLUP方法估计绵羊育种值的试验研究
用BLUP方法估计绵羊育种值的试验研究程胜利,杨博辉,郭 宪,郞 侠,冯瑞林(中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃兰州 730050)
摘 要:探求加快肉羊改良遗传进展,缩短世代间隔一直是绵羊数量遗传研究者追求的一个目标。根据BLUP原理,利用甘肃省皇城种羊场2000~2003年共1223只绵羊的周岁重数据资料,对绵羊周岁重性状进行不同模型的比较分析,筛选出估测绵羊周岁重性状育种值的动物模型y=Xb+Za+Wm+Sl+e,并估测出55只种公羊的育种值大小。关键词:绵羊,BLUP,周岁重,育种值
BLUP(BestLinearUnbiasedPrediction)法是美国数量遗传学家G.R.Henderson于1972年提出的。与其它方法相比,在种畜遗传评定方面,BLUP方法最大的优点是估计误差最小,育种估计值更接近于真实值,是一种畜禽遗传评定的优秀方法。它最初应用于奶牛的后裔鉴定,后又逐渐用于肉牛、猪、奶山羊、绒山羊、绵羊、兔等的选育研究。在我国,奶牛和肉牛的BLUP预测已有成熟的技术,在羊的研究方面,以前在绒山羊有过一些探讨,但在绵羊肉用性状研究方面仅有零星报道。本研究的目的就是应用BLUP原理来研究绵羊肉用性状周岁重的估测方法,筛选适合西北生境条件的切实可行的绵羊选种方法,估测种羊育种值的大小,从而加快肉羊改良遗传进展,缩短世代间隔。
1 材料与方法
1.1 材料 本研究数据来源于2000—2003年甘肃省皇城种羊场55只种公羊的1223只子女的周岁重鉴定记录。1.2 方法1.2.1 固定效应的筛选 应用SPSS11.0中的GLM方法对可能影响绵羊周岁重的出生类型(单羔、双羔)、性别、出生年份和各分场进行方差分析。1.2.2 混合线性模型设计 根据BLUP方法原理,结合育种群的实际情况,设计了四种估测周岁重性状可能的线性模型如下:
y:各性状观察值向量b:固定效应;a:个体加性遗传效应m:母体加性遗传效应;l:母体永久环境效应e:残差效应向量;X、Z、W、S分别为固定效应、个体加性效应、母体加性遗传效应、母体永久环境效应的结构矩阵。
1.2.3 建立混合模型方程组 根据线性模型理论,混合模型方程组可表示如下:
1.2.4 混合线性模型的筛选 将所有个体按出生早晚分个体号、父亲号、母亲号排列构建系谱文件。再按出生早晚依次排个体号、父亲号、母亲号、固定效应、性状观察值,构建数据文件。应用mtdfremal软件,分别计算上述四种线性模型的方差组分及其比例。
2 结果与分析
2.1 固定效应的方差分析 由表1可以看出,绵羊周岁重除了出生类型及出生类型×分场的互作效应影响不显著外(P>0.05),出生年份、分场、性别以及其余互作效应均有显著影响(P<0.05)。
表1 周岁重的GLM方差分析
影响因素 周岁重 Ms df F p 出生年份 937.949 3 32.076 0.000 分场 301.918 2 9.788 0.000 性别 8430.822 1 336.121 0.000 出生类型 75.240 1 3.061 0.081 出生年份×分场 395.038 11 13.968 0.000 出生年份×性别 1764.065 7 79.104 0.000 出生年份×出生类型 469.710 5 21.971 0.000 分场×性别 1785.330 5 72.015 0.000 分场×出生类型 39.678 5 1.617 0.153 性别×出生类型 767.814 3 35.877 0.000 2.2 不同模型的方差组分及其比例 从表2可以看出,在四种模型中,残差方差占表型方差比例最小的为模型(4);而加性遗传方差、母体遗传方差、母体永久环境方差占表型方差比例最大的均为模型(4)。
表2 不同模型的方差组分及其比例
性状 模型 σp2 σe2 σa2 σm2 σc2 σc2% σm2% σa2% σe2% 周岁重 1 19.76465 18.12416 1.64050 ? ? ? ? 0.08 0.92 2 19.74649 17.34452 1.58867 1.00521 ? ? 0.05 0.08 0.88 3 19.75608 17.35950 1.58992 ? 0.80666 0.04 ? 0.08 0.88 4 19.98053 12.19875 3.02249 2.65320 4.93790 0.25 0.13 0.15 0.61 注:σp2:表型方差;σe2:残差方差;σa2:加性遗传方差;σm2:母体遗传方差;σc2:母体永久环境方差。
3 讨论
3.1 固定效应的筛选3.1.1 出生年份 出生年份对周岁重性状
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