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结合基因芯片和MAS工具分析丙戊酸钠诱导NB4细胞分化的分子机制.pdf

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第48卷2012年第6期 西 北师范大学学报(岛然科学版) V01.482012No.6 ofNorthwestNormal Journal Science) 69 University(Natural 结合基因芯片和MAS工具分析 丙戊酸钠诱导NB4细胞分化的分子机制 王 晶1,柳立军2,俞诗源3,周玉祥h (1.清华大学医学院,北京100084; 2.兰州大学第一医院生殖医学中心,甘肃兰州 730000; 3.西北师范大学生命科学学院,甘肃兰州 730070) 摘 要:为了研究丙戊酸钠(Sodium 因组表达谱芯片分析了VPA处理NB4细胞分化后差异表达的基因,并利用MAS等生物信息学工具对芯片结果做了 mmo卜L_。VPA处理NB4细胞48 进一步的分析.结果表明,2 h后,可明显抑制细胞的生长,增加分化抗原(CDllb) 的表达;在细胞诱导分化过程中,有】640个基因的表达发生了显著改变(变化倍数≥2);这些差异表达基因参与许 多重要的生物学过程,其中,细胞周期、氨基酸代谢、DNA修复和MAPK信号通路是细胞诱导分化过程中显著富集 的通路.利用实时荧光定量PCR技术,对芯片筛选到的8个差异表达基因进行了验证,证明这些基因是VPA诱导 NB4细胞分化的作用靶点.芯片技术和生物信息学分析工具的联合应用是研究抗肿瘤药物作用杌截的有效途径. 关键词:丙戊酸钠;早幼粒白血病;组蛋白去乙酰化转移酶;基因芯片;信号通路 中图分类号:R733.7 文献标识码:A 文章编号:1001—988X(2012)06—0069—07 themolecular in Analyzing mechanismssodium differentiationofNB4cells valproate——induced using combinedwiththeMASt001 microarray WANG Li—jun2,YU Jin91,LIU Shi—yuan3.ZHOUYu—xian91 (1.SchoolofMedicine,TsinghuaUniversity,Beijing100084,China; Medicine 2.ReproductiveCenter,theFirst ofLanzhou Hospital University,Lanzhou730000,Gansu,China; ofLife Normal 3.CollegeScience,Northwest 730070,Gansu,China) University,Lanzhou Abstract:Tothemechanisms theeffectofsodium human explore underlying cell leukemialineNB4,the is to promyelocytic

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