柿EST-SSR引物的开发及筛选 Development and screening of EST-SSR markers in Diospyros kaki Thunb.pdfVIP

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2018-02-01 发布于上海
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柿EST-SSR引物的开发及筛选 Development and screening of EST-SSR markers in Diospyros kaki Thunb.pdf

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柿EST-SSR引物的开发及筛选 Development and screening of EST-SSR markers in Diospyros kaki Thunb

第30卷第3期经济林研究 V．01．30No．3 2012年9月 NonwoodForestResearch Sep．2012 柿EST-SSR引物的开发及筛选吴硕1，傅建敏1，乌云塔娜2，梁玉琴1，李芳东1 (1．中国林业科学研究院经济林研究开发中心，河南郑州450003： 2．中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室，湖南长沙410004) 474条柿属EST序列开发柿EST-SSR引物，并用于摘要：为丰富柿树SSR引物来源，利用从NCBI下载的9 分析7个柿品种的遗传多样性。EST序列经去除低质量及冗余片段后拼接成1390条重叠序列和4097条无重复引物的31％，其中14对引物有多态性，占可扩增引物的45．2％。同时发现引物68是临潼板柿的特异引物。引的特异性标记位点。关键字：柿；EST；SSR标记中图分类号：$665．2 文献标志码：A and ofEST-SSRmarkersin Developmentscreening WE YUN Shu01，FUJian—minl，WUTa-na2，LIANG Yu—qinl，LIFang—don91 (1．Non-timberForestResearchandDevelopmentCenter,ChineseAcademy 2．The LabofNon-woodForestProduct South Key ofForestryMinistry,CentralUniversity 410004，Hunan，China) Changsha ordertoenrichSSR sourcesof kaki makerswere from9474 Abstract：In Thunb．，SSR primer Diospyros developed L．in and wereusedto diversities7 cultivarofD．kaki．1390 ESTsof NCBIdatabase Diospyros they analyze among and4097 wereassembled andredundant repeatedsequences non--repeatedsequences byremovinglow·-quality fragments 1 inESTs SSRsin601 EST weresearched for0．96％of total，540 sequences．In sequences out，accounting ESTs，among which61．06％ofSSRswasdinucleotides．Onehundred were forPCR of7cultivars．