水稻Osrdr1突变体全基因组 CCGG位点甲基化的研究 Methylation of Genome-wide CCGG Sites of Osrdr1 Mutant in Rice.pdfVIP

吉林农业大学学报　 ２０１４，３６（６）：６３８～６４４ ｈｔｔｐ：／ ／ ｘｕｅｂａｏ．ｊｌａｕ．ｅｄｕ．ｃｎ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ＪｉｌｉｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｅ⁃ｍａｉｌ：ｊｌｎｄｘｂ＠ｖｉｐ．ｓｉｎａ．ｃｏｍ 水稻 Ｏｓｒｄｒ１突变体全基因组 ＣＣＧＧ位点甲基 化的研究∗ １∗∗ ２ １，３ １ １ 王宁宁 ，王　 慧 ，陈　 亮 ，李　 过 ， 门秋影 １．吉林农业大学农学院，长春 １３０１１８；２．莱芜市第一中学，莱芜２７１１００；３．长春市第十七中学， 长春 １３００２１ 摘　 要：ＤＮＡ胞嘧啶甲基化变异调控植物基因组内功能基因表达和转座子转座活性，影响植物生长和发育 的稳定性。 ＲＮＡ⁃ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ２（ＲＤＲ２）基因参与ＲＮＡ⁃ｄｉｒｅｃｔｅｄ ＤＮＡ ｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ（ＲｄＤＭ）途径指 ＝ 导合成ＣＨＨ（Ｈ Ｇ、Ｔ、Ａ）甲基化，ＣＨＨ 甲基化在基因和转座子上表现不同，是目前ＤＮＡ胞嘧啶甲基化的研究 热点之一。 拟南芥中ＲＤＲ１基因与ＲＤＲ２属于同一家族，最新研究结果证实，ＲＤＲ１基因不仅可以指导ＣＨＨ 甲基化形成，并且其功能缺失会不同程度影响ＣＧ 和ＣＨＧ 甲基化。 前期研究工作表明，水稻中其同源基因 ＯｓＲＤＲ１功能缺失可在特异位点影响ＤＮＡ胞嘧啶甲基化，但是否大规模影响全基因组ＤＮＡ 甲基化尚不明 确。 在此基础上，采用甲基化敏感多态性扩增（Ｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ ｓｅｎｓｉｔｉｖｅ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ，ＭＳＡＰ）技术研 究ＯｓＲＤＲ１基因功能缺失突变体全基因组ＣＣＧＧ位点的甲基化情况。 结果同野生型比较分析发现，ＯｓＲＤＲ１ 基因功能缺失没有引起全基因组ＣＣＧＧ位点甲基化水平的显著变化，但一定程度产生ＣＨＧ 去甲基化变异。 由于ＭＳＡＰ 试验方法的局限性，关于Ｏｓｒｄｒ１突变体全基因组ＤＮＡ胞嘧啶甲基化变异还需更深入研究论证。 关键词：ＯｓＲＤＲ１基因；ＤＮＡ胞嘧啶甲基化；水稻 中图分类号：Ｑ９４３；Ｓ５１１　 　 　 文献标识码：Ａ　 　 　 文章编号：１０００⁃５６８４（２０１４）０６⁃０６３８⁃０７ ＤＯＩ：１０．１３３２７／ ｊ．ｊｊｌａｕ．２０１４．１８２３ 引文格式：王宁宁，王慧，陈亮，等．水稻Ｏｓｒｄｒ１突变体全基因组ＣＣＧＧ位点甲基化的研究［Ｊ］．吉林农业大学 学报，２０１４，３６（６）：６３８⁃６４４． Ｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ ｏｆ Ｇｅｎｏｍｅ⁃ｗｉｄｅ ＣＣＧＧ Ｓｉｔｅｓ ｏｆ Ｏｓｒｄｒ１Ｍｕｔａｎｔ ｉｎ Ｒｉｃｅ １ ２ １，３ １ １ ＷＡＮＧ Ｎｉｎｇ⁃ｎｉｎｇ ，ＷＡＮＧ Ｈｕｉ ，ＣＨＥＮ Ｌｉａｎｇ ，ＬＩＧｕｏ ，ＭＥＮ Ｑｉｕ⁃ｙｉｎｇ １． Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ａｇｒｏｎｏｍｙ，ＪｉｌｉｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｃｈａｎｇｃｈｕｎ １３０１１８，Ｃｈｉｎａ；２． Ｔｈｅ Ｆｉｒｓｔ Ｈｉｇｈ Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｌａｉｗｕ，Ｌａｉｗｕ ２７１１００，Ｃｈｉｎａ；３． Ｔｈｅ Ｓｅｖｅｎｔｅｅｎ Ｈｉｇｈ Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｃｈａｎｇｃｈｕｎ，Ｃｈａｎｇｃｈｕｎ １３００２１，Ｃｈｉｎａ Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＤＮＡ ｃｙｔｏｓｉｎｅｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎｐｌａｙｓａｎｉｍｐｏｒｔａｎｔｒｏｌｅｉｎｒｅｇｕｌａｔｉｎｇｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ａｎｄａｃｔｉｖｉｔｙ ｏｆｔｒａｎｓｐｏｓａｂｌｅｅｌｅｍｅｎｔｓ（ＴＥｓ），ｗｈｉｃｈｉｍｐａｃｔｓｔｈｅｓｔａｂｉｌｉｔｙ ｏｆｐｌａｎｔｇｒｏｗｔｈａｎｄｄｅｖｅｌｏｐ⁃ ｍｅｎｔ． ＲＮＡ⁃ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ２（ＲＤＲ２）ｗａｓ ｉｎｖｏｌｖｅｄ ｉｎ ＲＮＡ⁃ｄｉｒｅｃｔｅｄ ＤＮＡ ｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ