基因网络中重要节点的挖掘研究论文讲演稿.pptVIP

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2018-02-11 发布于天津
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基因网络中重要节点的挖掘研究论文讲演稿.ppt

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基因网络中重要节点的挖掘研究;目录;复杂网络研究历程;安徽农业大学信息与计算机学院;复杂网络的研究意义;重要节点挖掘方法概述;研究中选取的三种挖掘方法介绍;拟南芥花药基因网络的构建; 根据上图在第一行有三个基因，每个基因对应一个文件名，把其做为靶基因，下列文件的每一行都代表一个拟南芥花药基因，它们和靶基因之间存在一定的关系，主要指标有表中的相关系数来确定，取第三列系数为两者的相关系数，其阀值的设定为0.6，通过这些表和数据可以构建拟南芥花药基因网络，每个拟南芥基因为一个节点，若两个基因之间的相关系数超过0.6，则在两个节点之间用边连接起来，由此可以得到拟南芥基因组成的复杂网络。下图为pajek 网络分析软件对预测到得 6836 对调控关系基因对可视化的结果：;对图形优化后得出下图作为复杂网络进行分析，挖掘出重要??点并进行分析：;三节点收缩法,它对节点的分析并不是通过删除，而是收缩某节点看整个网络是否可以更好的凝聚 ;实验结果如下：;三种方法的比较; 程序的分析与展示： ;打开Myeclipse程序：;程序运行效果截图：;选择节点收缩法：;4 总结与展望;谢谢!