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509-卡方检验
第七章 检验 (卡方检验) 本章主要介绍卡方检验的基本概念、独立性检验方法、适合性检验方法 在科研工作和渔业生产中,我们经常会碰到许多质量性状方面的资料,这些资料可以转化成率后使用 t-test 方法进行检验,但这仅限于一个样本率与总体率的比较、两个样本率间的比较 除此之外,我们还可以用 检验来完成检验工作 特别当有多个样本进行比较时,必须用 检验来完成 第一节 的概念 在第四章中,我们讨论过 分布 有两个定义: 定义一: 定义二: 前一个定义是针对数量性状资料的 而后者主要是针对质量性状资料的 在遗传学中,我们研究某一性状是否受一对等位基因的控制,该性状在后代的分离比例是否符合某种规律 例1 孟德尔的豌豆花试验(红花 705 朵、白花 224朵):这一分离是否符合他自己提出的 3:1 的分离比例的假设? 如果这一 3:1 的理论比例是正确的,那么这一试验所出现的红花和白花的理论比例应当是: 红花:696.75 白花:232.25 显然,实际出现的红花、白花的朵数与理论值之间有一定的差异(如何用 t-test来完成这一检验?) 连续进行多次试验,每一次的结果都不会相同,每一次的结果都不会刚好符合理论值 可以这样设想:观察值与理论值之间的差距越小,表示试验结果与理论值越相符;反之,观察值与理论值之间的距离越大,表示试验结果与理论值越不符,当这一差值大到一定程度时,我们就可以认为豌豆花的颜色是不受一对等位基因控制的,可能是另外一种遗传模式 但如何来界定这种相符或不相符? 当我们将这两个差值相加,我们会发现其和为 0,可以说,任何类似的问题其结果都是 0: (705-696.75)+(224-232.25)= 0 差值的平方和相加,其结果不会为 0了,且由于平方,使得原来较大的差变得更大了,因而增大了分析问题的灵敏性 但由于每次试验的样本量不会相等,因而缺乏可比性,以理论值为标准进行比较,问题就解决了 上例中:红花: 白花: 两者之和: 例2 正常情况下,中国婴儿的性别比为:♂51:♀49 即每出生 100 个女婴,就有 103~105 个男婴 统计某地区连续 3年的婴儿性别比,得:男婴4691人:女婴4159人,试问该地区的新生儿性别比正常吗? 我们用列表的方式检查之: 婴儿性别 实际值(O) 理论值(E) O-E 男婴 4691 4513.5 177.5 6.98 女婴 4159 4336.5 -177.5 7.27 合计 8850 8850.0 0 14.25 显然,这一 值较大 ,有可能这一地区的婴儿出生性别比不太正常(请用 t-test 进行检验,看这一性别比是否符合常规性别比) 例3 长翅灰身(LLGG)的果蝇与残翅黑檀体(llgg)果蝇交配,其后代F1全为长翅灰身,F1自群繁育,结果出现了 4 种表现型:长灰(1477)、长黑(493)、残灰(446)、残黑(143),现假定控制翅膀长度和身体颜色的两对基因是相互独立的,且都是显隐性关系,则四种类型的果蝇其比例应当是 9:3:3:1 现需验证这次试验的结果是否符合这一分离比例 长翅灰身(LLGG)× 残翅黑檀体(llgg) 长翅灰身(L_G_) 长灰 长黑 残灰 残黑 (1477) (493) (446) (143) 1477 + 493 + 446 + 143 = 2559 以上三个例子都要求我们判断观测值与理论值之间是否相符,而我们都可以得到一个 值 检验的一般步骤: 首先作无效假设 其次计算 值 最后根据 值出现的概率判断无效假设是否成立 自由度不同, 分布是不同的 分布的自由度仅与性状的类别有关,而与次数无关,例 1 中有两类花,因此其自由度为 2-1 = 1 例 3 中有 4 类果蝇,因此其自由度为 4-1 = 3,等等 当自由度为 1时, 检验应作连续性校正,校正的 检验公式记作 由于χ2分布是连续性分布,被检验的资料是离散型的分类资料,而从离散型资料得到的统计量只是近似地服从χ2分布,因此,为了保
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