基因组的结构与功能稿件教材讲义.pptVIP

第三章 基因组的结构与功能 ;基因组概述;不同生物物种的基因组大小比较 ;三、不同生物基因组的结构与组织形式也明显不同;基因组信息 人类基因组： 编码区域只占2%-3% 对于非编码序列，尚不清楚其含义或功能 非编码区域对于生命活动具有重要的意义 包括内含子、简单重复序列、移动元件、假基因 重复序列: 大卫星（macro-satellite）DNA 小卫星（mini-satellite）DNA 微卫星（micro-satellite）DNA 顺式调控元件: 启动子、增强子、沉默子;第二节 不同病毒基因组的核酸具有不同特点 ;Date;一、病毒基因组核酸的主要类型 ;SARS病毒简介;二、病毒基因组结构与功能的特点;③ 病毒基因组有连续的也有不连续的 DNA 病毒基因组均由连续的DNA分子组成；多数RNA病毒基因组也由连续的核糖核酸链组成，但有些则以不连续的核糖核酸链组成。 ④ 病毒基因组的编码序列大于90％ 病毒基因组的大部分是用来编码蛋白质的，只有很小部分不编码蛋白质。 ⑤ 单倍体基因组 除逆转录病毒基因组有两个拷贝外，至今发现的病毒基因组都是单倍体，每个基因在病毒颗粒中只出现一次。 ;⑥ 基因有连续的和间断的 感染细菌的病毒（噬菌体）基因组与细菌基因组结构特点相似，基因是连续的；而感染真核细胞的病毒基因组与真核生物基因组结构相似，有内含子，基因是间断的。 ⑦ 相关基因丛集排列 病毒基因组核酸序列中功能相关的几个蛋白质基因丛集在基因组的一个或几个特定部位，形成一个功能单位或转录单元，受同一个转录调控机制调节，它们可被一起转录成为多顺反子mRNA，然后加工成为各种蛋白质的模板。 ;⑧ 基因重叠 有些病毒在进化过程中形成重叠基因，即同一段核酸序列能编码2种或2种以上蛋白质。这些重叠基因虽然共用一段核酸序列，但转录出的mRNA链阅读框不同。 ΦX174噬菌体的基因结构 Ala Glu Gly Val Met 终止 - G C GˊG A A ˊG G A ˊG T GˊA T G ˊT A Aˊ T G Tˊ C T- Arg Lys Glu 终止 起始 Ser;噬菌体?x174基因图谱;Date;举例：SV40病毒基因组;典型病毒基因组介绍;第三节 原核生物基因组比较简单 ;原核生物转录后的mRNA结构图;一、原核基因组结构与功能的特点 ;Nucleoid (类核,拟核) – Bacterial chromosome 细菌染色体;2.基因组中只有1个复制起始点。 3.基因操纵子结构。操纵子（operon）是指数个功能相关的结构基因（sructure gene）串联在一起，构成信息区，连同上游的调控区（包括启动子和操纵基因）以及下游的转录终止信号所构成的基因表达单位，所转录出的RNA为多顺反子。 4. 编码序列一般不重叠。 5.基因是连续的，无内含子，转录后不需要剪接（切）。 6.编码区在基因组中所占的比例（约占50％）远远大于真核基因组，但小于病毒基因组。非编码区主要是一些调控序列。;7.基因组中很少有重复序列。编码蛋白质的结构基因多为单拷贝，而编码rRNA的基因往往是多拷贝的。 8.细菌基因组中存在有可移动的DNA序列，包括插入序列和转座子。 9.具有编码同工酶的基因。 10.在DNA分子中具有多种功能的识别区域，如复制的起始区、复制终止区、转录启动区转录终止区等。这些区域往往具有特殊的序列，并且含有反向重复序列。;Date;五、细菌基因组中的可移动成分产生转座现象 ;IR的对称结构使IS可以双向插入靶位点，并在插入后于两侧形成一定长度（3～11bp）的顺向重复序列（ direct repeat sequence , DR ），DR是靶位点序列复制的产物。 ⑵ 转座子 转座子（transposon , Tn）是一类较大的可移动成分，除有关转座的基因外，至少带有一个与转座作用无关并决定宿主细胞（菌）遗传性状的基因。转座子中的转位酶常称为转座酶，其功能是介导转座子插入到DNA的其他部位。 ⑶ 可转座的噬菌体 可转座的噬菌体（transposable phage）是一类具有转座功能的溶源性噬菌体，包括Mu和D108等。;Date;简化的转座过程;（二）转座因子的几个遗传效应;转座子具有反向末端重复序列以及在靶部位两侧产生的同向重复序列。在该例中靶序列为5bp，转座子末端由9bp反向重复序列组成，数字1-9指序列