《生物信息学应用技术》王禄山著.pdf

[General Information] 书名=生物信息学应用技术 作者=王禄山，高培基主编 页数=253 出版社=北京市：化学工业出版社 出版日期=2008.01 SS号 DX号=000004954219 URL=/bookDetail.js p?dxNumber=000004954219d=0902603DA5467713D EA897E68B3407C4 版权 目录 第1章 信息学与生物信息学技术 1.1 信号、信息、密码与生物信息学技术 1.2 生物信息学技术的特点 1.2.1 生物信息的储存与传递 1.2.2 生物信息传递的密码子 1.2.3 信息和密码的层次性 1.2.4 信息传递中的“非等价”与多义表达 1.2.5 内含子、重复序列与DNA多态性 1.2.6 基因突变和中性突变理论 1.3 生物系统的复杂性和生物信息学技术研究的局限性 第2章 生物信息数据 2.1 核酸的序列与表示方式 2.2 蛋白质的序列与表示方式 2.3 生物信息数据的存储格式 2.3.1 序列最简单注释的FASTA格式 2.3.2 序列详细注释的GenBank格式 2.3.3 序列详细注释的EMBL格式 2.4 生物大分子结构数据的存储格式 第3章 生物信息数据库 3.1 生物信息数据库概述 3.1.1 数据库 3.1.2 生物信息数据库 3.1.3 生物信息数据库分类及发展方向 3.2 核酸序列数据库 3.2.1 核酸序列基本数据库 3.2.2 核酸序列二级数据库 3.3 蛋白质序列数据库 3.3.1 蛋白质序列基本数据库 3.3.2 蛋白质序列二级数据库 3.4 生物大分子结构数据库 3.4.1 生物大分子结构基本数据库 3.4.2 蛋白质结构二级数据库 第4章 生物信息的检索及策略 4.1 生物信息检索概述 4.1.1 信息检索的概念 4.1.2 检索系统的类型 4.1.3 生物信息检索系统 4.1.4 信息检索策略 4.2 NCBI数据库检索系统Entrez 4.2.1 美国国家生物技术信息中心NCBI 4.2.2 NCBI数据库 4.2.3 Entrez简介 4.2.4 Entrez系统检索规则与策略 4.2.5 Entrez检索策略的定制 4.3 EBI的数据库检索系统SRS 第5章 序列的分析与相似性搜索 5.1 序列分析与相似性搜索概述 5.2 序列比对 5.2.1 序列比对的原理 5.2.2 记分规则 5.2.3 序列比对算法 5.2.4 多序列比对算法 5.3 基于相似性分析的数据库搜索