生物信息学基础演示课件.pptVIP

(2) 药物基因组学 1）问题的提出： 不同的病人对同一种药物有不同的反应。 药物基因组学可以运用大范围系统的基因组技术，找出与药物作用有关的基因。在基因水平上设计，避免病人服用无效、低效的药物，从而结束单一处方的时代。带来突破性的革命。 2）药物基因组学与遗传多态性 药物基因组学正是从基因水平揭示这些差异的遗传特征，鉴别基因序列中的差异。用更科学的手段看病开药，即依照病人的基因组特征优化药疗方案。 药物基因组学需要检测基因序列中差异的位置，碱基位置的置换，确定一个基因中多种差异的相对位置等。 3）药物基因组学与药物开发的未来 药物基因组学提供了能被检测的全新的基因范围— 药物应答基因，所以利用药物基因组学可以实现药物的目标化。 例子：Novatis公司的精神分裂症药-- 氯氮平，是治疗精神分裂症药的首选药，但1%的病人服用后会得一种危及生命的病 — 粒细胞缺乏症。从而大大影响了市场。如果通过药物基因组学的研究，检测出粒细胞缺乏症的药物应答基因，将大大拓宽市场。另外在药物进入临床时，清楚了相关的药物应答基因，对受试人群进行基因分型，可以准确地知道该种药物适合哪些病人。 有关药物作用的遗传影响与生物反应的变异性的信息将在新药的设计、发现和成功开发方面起重要作用。 美国NIH于1998年计划建立一个药物基因组学数据库，搜集“个体”基因及其功能的资料，以便于药物的开发。1997年以来，已经有几十家药物公司进入药物基因组学领域。有人估计， (3). 药物分子设计 1). 新药研制的四类方法 2). 基于作用机理（受体结构）的药物分子设计 Structure based drug design ( or Rational drug design) 3).基于作用机理（受体结构）的药物分子设计的一般步骤 7.4.4 序列比对 序列比对的进化基础 图7.1、保守位点通常在功能上极为重要。对老鼠的胰蛋白酶（Swiss-Prot P07146）和小龙虾的胰蛋白酶（Swiss-Prot P00765）作比对，相同的残基用下标线标出，在比对上方标出的是三个二硫键（-S-S），这些二硫键中的半胱氨酸残基极为保守，打星号的残基的侧链参与电荷传递系统，打菱形符号的活性位点的残基负责底物的特异性。 Human-ZCr MATGQKLMRAVRVFEFGGPEVLKLRSDIAVPIPKDHQVLIKVHACGVNPVETYIRSGTYS Ecoli-QOR ------MATRIEFHKHGGPEVLQA-VEFTPADPAENEIQVENKAIGINFIDTYIRSGLYP . . ******. . . * …. . . * *.* ..****** * Human-ZCr RKPLLPYTPGSDVAGVIEAVGDNASAFKKGDRVFTSSTISGGYAEYALAADHTVYKLPEK Ecoli-QOR -PPSLPSGLGTEAAGIVSKVGSGVKHIKAGDRVVYAQSALGAYSSVHNIIADKAAILPAA * ** *.. **.. ** . * **** . . * *. ** Human-ZCr LDFKQGAAIGIPYFTAYRALIHSACVKAGESVLVHGASGGVGLAACQIARAYGLKILGTA Ecoli-QOR ISFEQAAASFLKGLTVYYLLRKTYEIKPDEQFLFHAAAGGVGLIACQWAKALGAKLIGTV . * * ** . * * * .. .* * * * *.***** *** *.* * *..** Human-ZCr GTEEGQKIVLQNGAHEVFNHREVNYIDKIKKYVGEKGIDIIIEMLANVNLSKDLSLLSHG Ecoli-QOR GTAQKAQSALKAGAWQVINYREEDLVERLKEITGGKKVRVVYDSVGRDTWERSLDCLQRR ** . . *. ** .* * ** …. * * * . .. . . . . * * . Human-ZCr GRVIVVG-SRGTIEINPROTMAKES----SIIGVTLFSSTKEEFQQYAAALQA