基因组测序-山东大学课程中心.pptVIP

基因表达调控分析 四个水平上的基因表达调控：转录水平、转录后水平、翻译水平、翻译后水平。 山东大学数学学院李国君教授： BOBRO – A BOTTLENECK BROCKEN TOOL FOR MOTIF FINDING Nucleic Acids Research (IF 7.5) /~maqin/motif_finding/index.html RNA二级结构预测 长链非编码RNA或tRNA可通过自身碱基互补形成二级结构，如三叶草结构，来行使调解蛋白质功能的功能。 蛋白质三维结构 蛋白质四个水平上的结构： 蛋白质三维结构 all beta alpha+beta all alpha 蛋白质二级结构预测 已知一个蛋白质的氨基酸序列，预测其二级结构。 常用软件：PSIPRED, APSSP2, NNPREDICT, PREDICTPROTEIN 蛋白质三维结构预测 已知一个蛋白质的氨基酸序列，预测其三维结构。 三类方法：1. 同源建模法；2. 穿线法；3. 从头预测法。 前两类方法合称为基于模板法。 MEAKIVKVLDSSRCEDGFGKKRKRAASYAAYVTGVSCAKLQNVPPPNGQCQIPDKRRRLEGENKLSAYENRSG