[农学]作物育种学_孙其信_分子标记.pptVIP

To use DNA you need a roadmap 分子标记的特点： （1）直接以DNA的形式表现，表现稳定 （2）数量多 （3）多态性高 （4）表现为中性，不影响目标性状的表达； （5）许多标记表现为共显性的特点，能区别 纯合体和杂合体。 （6）成本不太高 第一节分子标记的类型和作用原理 一、分子标记的类型和特点 类型（按技术特性分类） 二、分子标记的原理和遗传特性 (一)RFLP标记 1.RFLP标记的原理 植物基因组DNA上的 碱基替换、插入、缺失 或重复等，造成某种限 制性内切酶酶切位点的 增加或丧失，从而产生 限制性片断长度多态 性。 2.RFLP标记的特点 （1）遍布于整个基因组， 数量 几乎是无限的； （2）无表型效应， 不受发育阶段器官特异性限制； （3）共显性， 可区分纯合子和 杂合子； （4）结果稳定、可靠； （5）DNA需要量大，检测技术繁杂， 难以用于大规模的育种实践中 Target DNA fragment cloning and sequencing 2.AFLP标记的特点 （1）不需要事先知道DNA序列的信息， 可以用于任何动植物基因组的研究。 （2）多态性丰富 （3）标记多数具有共显性表达， 无复等位效应，表现孟德尔方式遗传。 （4）分析成本较高，对DNA的纯度和内切酶的 质量要求也较高。 (四)SSR 1.SSR标记的原理 根据微卫星DNA两端的单 拷贝序列设计一对特异引 物，利用PCR技术，扩增每个 位点的微卫星DNA序列，通过 电泳分析核心序列的长度多 态性。 2.SSR标记的特点 （1）SSR标记为共显性标记， 可鉴别出纯合子和杂合子。 （2）重复性高，稳定可靠。 （3）DNA用量少， 对DNA的质量要求也不太高。 （4）使用SSR技术需要知道重复序列两翼的 DNA序列。 The post-genome era in biological research will take for granted ready access to huge amounts of genomic data. The challenge will be understanding those data and using the understanding to solve real-world problems… How to use a genetic marker for marker-assisted selection 第二节 重要农艺性状基因连锁标记的筛选技术 目标基因的标记筛选（gene tagging）是进行分子标记辅助选择（MAS）育种的基础。 用于MAS育种的分子标记须具备三个条件： 一、遗传图谱的构建与重要农业性状基因的标记 遗传作图的原理 其原理是基于染色体的交换与重组。在细胞减数分裂时，非同源染色体上的基因相互独立，自由组合，而位于同源染色体上的连锁基因在减数分裂前期I非姊妹染色单体间的交换而发生基因重组，用重组率来表示基因间的遗传距离。遗传图谱只显示基因间在染色体上的位置，并不反映DNA的实际长度。 构建遗传图谱的主要环节： 根据遗传材料之间的多态性确定亲本组合，建立作图群体。 对群体中不同植株的标记进行基因性分析。 借助计算机程序构建连锁群 构建遗传图谱，首先要选择合适的亲本及分离群体，而且亲本之间的差异不宜过大，否则会降低所建图谱的准确度和适用性。 用于分子标记的遗传作图可分为两类： 暂时性分离群体，包括F2群体、BC等 永久性分离群体，包括重组自交系群体、加倍单倍体群体等 二、近等基因系的培育与重要农艺性状基因的标记 三、群体分离分析法与重要农艺性状基因的标记 四、数量性状基因的定位 第三节作物MAS育种 Marker-assisted selection for QPM maize (o2 gene) 一、作物MAS育种须具备的条件 分子标记与目标基因共分离或紧密连锁，一般要求两者间的遗传距离小