曙光5000A高性能计算平台建设建议书教案.docVIP

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曙光5000A高性能计算平台建设建议书教案

天津国际生物医药联合研究院 曙光5000A高性能计算系统 方案建议书 曙光信息产业(北京)有限公司 2009年3月 目录 1. 需求分析 5 1.1. 高性能计算的和大规模数据处理的应用 5 1.1.1. 计算机架构 5 1.1.2. 软件的并行特点 5 1.1.3. 互连网络 6 1.1.4. 操作系统 6 1.2. 曙光与中国的高性能计算 6 2. 系统方案设计 10 2.1. 方案总体设计 10 2.1.1. 设计原则 10 2.1.2. 方案配置表 13 2.1.3. 系统拓扑图 15 2.1.4. 系统方案说明 15 2.1.5. 系统方案特点及优势 16 2.2. 计算系统 17 2.2.1. 刀片集群 18 2.2.2. SMP胖节点 20 2.2.3. AMD Barcelona处理器优势 21 2.3. 互联网络 25 2.4. 存储系统 26 2.5. SKVM系统 26 2.6. 软件系统 28 2.6.1. 编译环境 28 2.6.2. 并行环境 30 2.6.3. 数学库 31 2.6.4. 调试器和性能分析器 32 2.7. 集群管理、监控系统 32 2.8. 作业调度系统 37 2.9. 曙光刀片集群优势分析 38 2.9.1. 计算密度更高 38 2.9.2. 机房要求降低 38 2.9.3. 功耗散热降低 38 2.9.4. 布线简单 38 2.9.5. 可靠性提高 39 2.9.6. 管理方便 39 3. 机房建设方案 40 3.1. 机柜尺寸和摆放要求 40 3.2. 机房环境要求 42 3.3. 供电和环境要求 42 4. 项目实施方案 43 4.1. 概述 43 4.2. 项目组主要人员名单 44 4.3. 项目管理控制 44 4.3.1. 过程控制 44 4.3.2. 项目文档管理 45 4.4. 项目实施方案 45 4.4.1. 服务器产品的包装和运输 46 4.4.2. 服务器设备到货验收 47 4.4.3. 安装调试验收 48 4.4.4. 设备验收 48 4.4.5. 项目完成总结 48 4.4.6. 交接和维护 48 4.5. 曙光高性能计算机安装调试标准 49 4.5.1. 调试规范 50 4.5.2. 安装、调试流程 52 4.5.3. 安装、调试目标 52 4.6. 曙光高性能计算机验收标准 53 4.6.1. 厂验 53 4.6.2. 初验 53 4.6.3. 终验 54 4.6.4. 验收所依照的技术标准 54 5. 用户服务方案 56 5.1. 售后服务承诺 56 5.1.1. 概要 56 5.1.2. 服务流程及响应时间 56 5.1.3. 质保期满后的售后服务费用 57 5.2. 高级技术支持及服务 58 5.2.1. 系统软件支持服务项目 58 5.2.2. 生物领域应用软件 58 5.2.3. 用户培训和长期合作计划 58 6. 培训方案 59 6.1. 概述 59 6.2. 培训目标 59 6.3. 培训讲师 60 6.4. 培训教材 61 6.5. 项目实施前培训 61 6.5.1. 培训方式 61 6.5.2. 培训地点 61 6.5.3. 培训人数 62 6.5.4. 培训内容 62 6.5.5. 培训时间 64 6.6. 现场培训 64 7. 曙光方案优势 66 7.1. “SUMA”标准的完美体现 66 7.2. 产品技术优势 66 7.3. 成熟方案 66 7.4. 售后服务 66 7.5. 高级技术服务和用户应用支持 67 7.6. 全面的用户培训 67 8. 产品介绍 68 8.1. TC2600刀片服务器 68 8.2. A950r-F 73 8.3. A620r-FX 77 8.4. 曙光DS6310FE系列磁盘阵列 79 9. 附件 84 9.1. 曙光公司介绍 84 9.2. 百万亿次曙光5000A超级机算机研发成功 86 9.3. “红色网格”-曙光TC4000A落户上海超算中心 92 9.4. 中国石油集团东方物理勘探公司 95 9.5. 华大基因使用曙光集群服务器 98 需求分析 高性能计算的和大规模数据处理的应用 高性能计算作为一种先进的科研手段,在国内的应用发展很快,得到了普遍的重视,近年来国家投入逐年加大。 高性能计算的应用条件已经成熟,表现在: 价格相对低廉的高性能机群系统为高性能计算应用提供了物质基础; 高性能计算应用的技术门槛逐渐降低; 国家鼓励相关单位做高性能计算的研究,相关投入不断加大; 很多高校的科研人员使用高性能计算手段,取得了很好的成果。 计算机架构 由于各学科高性能计算应用软件种类繁多,各种软件的应用特点也各不相同,对计算资源的需求存在差别,方案的设计需要充分考虑到实际应用的特点。 作为高性能计

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