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PCR级的质量单位换算
PCR级的质量单位换算
?DNA的检验方法及指标、单位换算
副标题:
2002-8-1 作者:liver411? 来源:HBV论坛
目前检验病毒的方法,除去血清培养基方法(HIV, CMV, HBV等病毒很难在培养基中分离检验),大致有三种::
PCR (polymerase chain reaction 或RT-PCR等),最常用的方法,很敏感,但误差大,价钱比较贵,通常单位用 copies/ml of plasma;
bDNA (branched chain DNA assay), 也是目前常用的方法,敏感,常规化,结果比较稳定,价钱比较便宜,通常单位用 units/ml of plasma (pg/ml, fg/ml);
NASBA (nucleic acid sequence-based amplification),不常用,很敏感,误差大,工时长,价钱最贵,通常单位用 units/ml of plasma (pg/ml, fg/ml);
就HBVDNA而论,目前测验HBV DNA时通常要达到两个目的。一个是定性(qualitative),另外一个是定量(quantitative) 。
HBVDNA定性的测验注重于HBVDNA的存在,它通常可以测到低于100copies/ml的病毒存在。当然还有更精确的方法,通常用于科研实验室中,可以测到更低的含量。 一般临床用的都可以测到1000-2000 copies/ml以上的精度。定性通常只给阴性、阳性的结果。
另外一方面,定量的测定着重于HBV DNA量存在的多少。通常用于定量的极限在0.1-5 pg/ml (1 pg/ml = 283,000 copies/ml)之间。同样,更精确的仪器可以测到0.001-0.005 pg/ml的精度。国外常用 fg/ml 为单位。copies/ml 比 fg/ml, pg/ml 单位更小。fg/ml, pg/ml 显示定量比 (?) X 10?易懂不容易错。
关于 copies/ml, pg/ml, fg/ml的换算大致如下:
Picogram: 1 pg = 10-12 g= 10-9 mg= 10-6 mg= 10-3 ng=?103 fg
Femtogram: 1 fg= 10-15 g= 10-12 mg= 10-9 mg= 10-6 ng= 10-3 pg
1 pg/ml = 283,000 copies/ml
HBVDNA正常指标
HBVDNA的正常指标或标准可以说是不能100%设定的。
定性测量的阳性通常说明病毒容易传染给他人, 阴性说明不容易传给他人。 一般讲血中测到少于1000copies/ml一下可为阴性。
定量测验, 因为结果是数字的, 而不是高低, 阴阳, 正常/不正常, 也就比较麻烦。确定正常值指标一定要知道所做实验的 参考范围 (reference range)。 参考范围是因测验的仪器,方法,试剂,病人年龄,性别,条件等而定的。 如,目前一般生产应用的Ultra Sensitive Quantitative PCR (高灵敏度定量PCR) 法的测验参考范围是在:
Less than 0.001 pg/mL
Less than 2.3 log copies/mL
Less than 200 copies/mL
Note: The reportable range is 0.001 to approximately 700 pg/mL, which is approximately equivalent to 2.3-8.3 log copies/mL (200 to 200,000,000 copies/ml)。
就是说这种方法可以测到参考范围是在0.001 到 700 pg/ml间, 约合在2.3-8.3 log 拷贝/毫升(200-200,000,000 拷贝/毫升)间;但是不同方法,仪器,批量这个范围不同而正常值(对照)也就不同。 现在技术先进,人们可以在大量生产时人为地把这个范围弄稳定/固定。
此外定量是根据拷贝/毫升决定多少而定。它只有量的定性! 只要测得到就是阳性,不是在一个病毒含量浓度没病,一个含量有病,何况测不到也不能说没病了 (下面细谈)。
所以要想知道结果的正确与否,含量高低等应该和所做DNA单位索取所用方法及仪器的参考范围及标准值或正常对照值。
查不到病毒DNA(Undetectable DNA)是不是就说明疾病治愈,不感染了?
查不到病毒的DNA不能说明已经不感染疾病,或者是治愈了。查不到病毒可能是因为现有仪器和水平不能测到更精确程度。目
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