基于EST￣SSR标记的莲属种质资源遗传多样性分析-计算机工程与科学.PDFVIP

植 物 分 类 与 资 源 学 报　 ２０１５ꎬ３７ (５): ５９５~６０４ Ｐｌａｎｔ Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ａｎｄ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 ＤＯＩ:１０.７６７７/ ｙｎｚｗｙｊ２０１５１５００４ 基于ＥＳＴ￣ＳＳＲ标记的莲属种质资源遗传多样性分析∗ １ꎬ２ꎬ３ ２ꎬ４ ２ ２ꎬ３ １ ２ꎬ３∗∗ 徐玉仙 ꎬ 张微微 ꎬ 莫海波 ꎬ 李　 春 ꎬ 曹建国 ꎬ 田代科 (１上海师范大学生命与环境科学学院ꎬ 上海　 ２００２３４ꎻ ２ 上海辰山植物园、 中国科学院上海辰山植物 科学研究中心ꎬ 上海　 ２０１６０２ꎻ ３ 上海市资源植物功能基因组学重点实验室ꎬ 上海　 ２０１６０２ꎻ ４ 上海农林职业技术学院ꎬ 上海　 ２０１６００) 摘要: 利用ＥＳＴ￣ＳＳＲ分子标记对３０个亚洲莲、 ６个美洲莲及 １４个亚美杂交莲品种 (野生居群) 进行遗传 多样性分析ꎬ 结果表明: 从 １２３对ＥＳＴ￣ＳＳＲ引物中筛选出５２对 (４２３％) 扩增稳定、 具有多态性的引物ꎻ 利用这５２对引物对５０个不同类型代表的莲属品种进行扩增ꎬ 共获得 １７７条多态性条带ꎬ 引物的等位基因 数和多态性信息量 (ＰＩＣ) 的范围分别为２~８个和０６３ (ＮＮＦＢ￣１０５９)￣０９１(ＮＮＦＢ￣７５０)ꎬ 平均为３４个和 ０７９ꎮ 利用ＮＴＳＹＳ￣ｐｃ２.１１软件对扩增结果进行Ｊａｃｃａｒｄ相似性系数分析ꎬ ５０个荷花品种材料遗传相似系数 为０２４~０８６ꎻ 通过ＵＰＧＭＡ法进行聚类分析ꎬ 在遗传相似系数０３７处供试荷花材料可分为４大类群: 亚 洲莲品种均聚类在Ｉ、 ＩＩ类群中ꎬ ＩＩＩ类群绝大部分为亚美杂交莲品种ꎬ ＩＶ类群为美洲莲ꎬ 亚美杂交莲品种 与亚洲莲品种的亲缘关系相对较近ꎬ 与传统分类及前人研究结果相一致ꎮ 关键词: 莲ꎻ ＥＳＴ￣ＳＳＲꎻ 遗传多样性ꎻ 亲缘关系 － － － 中图分类号: Ｑ １６　 　 　 　 　 　 　 文献标志码:Ａ　 　 　 　 　 　 　 文章编号:２０９５ ０８４５(２０１５)０５ ５９５ １０ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆＮｅｌｕｍｂｏ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎｓ Ｂａｓｅｄ ｏｎ ＥＳＴ￣ＳＳＲ Ｍａｒｋｅｒｓ １ꎬ２ꎬ３ ２ꎬ４ ２ ２ꎬ３ １ ２ꎬ３∗∗ Ｘｕ Ｙｕ￣ｘｉａｎ ꎬＺｈａｎｇ Ｗｅｉ￣ｗｅｉ ꎬＭｏ Ｈａｉ￣ｂｏ ꎬＬｉ Ｃｈｕｎ ꎬＣａｏ Ｊｉａｎ￣ｇｕｏ ꎬＴｉａｎ Ｄａｉ￣ｋｅ (１Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｌｉｆｅ ａｎｄ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ＳｃｉｅｎｃｅｓꎬＳｈａｎｇｈａｉＮｏｒｍａｌ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＳｈａｎｇｈａｉ ２００２３４ꎬＣｈｉｎａꎻ２ Ｓｈａｎｇｈａｉ Ｃｈｅｎｓｈａｎ Ｐｌａｎｔ ＳｃｉｅｎｃｅＲｅｓｅａｒｃｈ ＣｅｎｔｅｒꎬＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ ＳｃｉｅｎｃｅｓꎬＣｈｅｎｓｈａｎ Ｂｏｔａｎｉｃａｌ ＧａｒｄｅｎꎬＳｈａｎｇｈａｉ ２０１６０２ꎬＣｈｉｎａꎻ ３ＳｈａｎｇｈａｉＫｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｐｌａｎｔ Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ａｎｄ ＲｅｓｏｕｒｃｅｓꎬＳｈａｎｇｈａｉ ２０１６０２ꎬＣｈｉｎａꎻ ４ Ｓｈａｎｇｈａｉ Ｖｏｃａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ ａｎｄ ＦｏｒｅｓｔｒｙꎬＳｈａｎｇｈａｉ ２０１６００ꎬＣｈｉｎａ) Ａｂｓｔｒａｃｔ:ＥＳＴ￣ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒ