地方稻月亮谷花期控制基因Hd3aHd1Edh1和Ghd7的多态性分析.PDFVIP

分子植物育种( 网络版), 2012 年, 第10 卷, 第1164-1170 页 Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1 164-1170 研究报告 A Letter 地方稻月亮谷花期控制基因Hd3a 、Hd1 、Edh1 和Ghd7 的多态性分析 1 1 2 1 高东 , 毛如志 , 魏富刚 , 何霞红 1 云南农业大学农业生物多样性应用技术国家工程中心, 教育部农作物多样性与病害控制重点实验室, 植物病理重点实验室, 昆明, 650201 2 文山州植保站, 文山, 663000 通讯作者: gaodong521@ 作者 分子植物育种, 2012 年, 第10 卷, 第23 篇 doi: 10.5376/.2012.10.0023 收稿日期：2012 年04 月20 日 接受日期：2013 年04 月26 日 发表日期：2012 年05 月23 日 这是一篇采用Creative Commons Attribution License 进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条 件的使用与传播。 引用格式(中文) ： 高东等, 2012, 地方稻月亮谷花期控制基因 Hd3a 、Hd1 、Edh1 和 Ghd7 的多态性分析, 分子植物育种(online) Vol. 10 No.23 pp. 1164-1170 (doi: 10.5376/mpb. cn.2012.10.0023) 引用格式(英文) ： Gao et al., 2012, Analysis of Functional Nucleotide Polymorphisms in Hd3a , Hd1 , Edh1 and Ghd7 Genes Controlling Heading Date in Yuelianggu Landrace, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol. 10 No.23 pp. 1164-1170 (doi: 10.5376/.2012.10.0023) 摘 要 水稻抽穗期控制的关键基因已基本清楚，但是栽培稻花期多样性的分子机理仍然不清楚。本文利用重测序月亮谷 的全基因组序列、Takahashi 等(2009)在PNAS 上发表的部分数据和Xue 等(2008)在Nature genetics 发表的部分数据，研究了 Hd3a 、Hd1 、Edh1 和Ghd7 等4 个基因的核苷酸多态性。结果显示，月亮谷Hd3a 启动子区核苷酸多态性分布与前人报道的 有所不同，发现5 个特有的SNP 位点，分别位于-1 851 bp、-1 720 bp、-700 bp、-681 bp 和-1 607 bp 处；1 个特有的InDel ， 位于-523 bp 处。月亮谷Hd1 编码区其具有很高的多态性，发现6 个特有的SNP/InDel 位点，其中包括了所有4 个移码位点， 1 个插入位点和1 个缺失位点，月亮谷Hd1 属无功能的等位基因类型。月亮谷Ehd1 编码区SNP/InDel 与前人研究结果相似。 月亮谷 Ghd7 属于前人报道的有功能的等位基因 Ghd7-1。月亮谷抽穗期相关基因复杂的多态性，一方面与其生长环境垂直 海拔落差导致的“一山分四季，十里不同天”的复杂小生境有关，另一方面可能是其耐病、耐寒，适应性广的分子基础。 关键词 地方稻; 基因; 抽穗期; 单核苷酸多态性; 哈尼梯田 Analysis of Functional Nucleotide Polymorphisms in Hd3a, Hd1, Edh1 and Ghd7 Genes Controlling Heading Date in Yuelianggu Landrace G