马筱玲教授-安医讲座.pptVIP

金黄色葡萄球菌分子流行病学研究  研究背景 　 分子流行病学研究方法 以电泳为基础的方法：随机扩增DNA多态性（RAPD），重复序列PCR（rep-PCR），脉冲场凝胶电泳 （PFGE），限制性酶谱（REA），扩增片段长度多态性(AFLP) 方法简单方便，成本较低 但一般仅适用于对同一批标本的检测结果进行比较，不能与其他实验室的结果进行比较，不能了解不同地区流行的菌株之间是否有亲缘关系 分子流行病学研究方法 以测序为基础的方法：多位点序列分型（MLST），选择7个管家基因分别用PCR扩增，然后进行测序,比较多态位点的不同，得到不同的等位基因谱，再由专业软件进行分析和分型。 由于每一个管家基因都有很多等位基因，由7个管家基因排列的等位基因谱可达到2×1010个，所以不同菌株间具有相同的等位基因谱的可能性极小，也就是说具有相同等位基因谱的细菌被认为是来源于同一个祖先的细菌。 MLST分型 MLST分型的主要优势是监测结果精确，分辨力强，并且已经建立了国际数据库网站，各实验室的研究资料可以在网上进行比对，使不同时间、不同实验室的检测结果间有可比性，适用于大规模和长期的流行病学监测。 MLST与SA遗传背景分析 MLST与SCCmec分型 Enright等将MLST分型与SCCmec分型结合对MRSA的遗传学特征和耐药基因盒特征进行综合描述，用该方法对来自20个国家的35