16-11-4代谢组学数据.pptxVIP

代谢组学数据;主要内容;什么是代谢组学？;代谢组学分析技术; 近10年来,在疾病标记物研究、药物开发、毒性评价、营养、植物和微生物代谢网络和代谢工程研究、环保等应用方面已经取得了一定的成绩。;代谢组学数据处理流程;代谢组学数据获取及数据格式;XML格式文件;Metlin (Scripps Center for Metabolomics) 简介和特点：Metlin数据库，是由The Scripps Institute Gary Siuzdak组创立，主要侧重用于非靶向代谢组学(Non-targeted Metabolomics)代谢产物鉴定用。网站的主要特征是具有大量的代谢产物的MS/MS图谱，而且每个化合物物都有不同的碰撞能图谱，可以清晰的找到代谢产物的碎片离子。用户还可以获得分子量，化学结构式，化学结构等信息。 该数据库的主要缺陷：没有代谢产物在生物体中的浓度，代谢通路等信息。没有临床相关的信息，偏重于化学分析。;KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 简介和特点：KEGG 数据库，是由日本京都大学于1995年创立，是世界上最大、最全的生物信息学数据库之一。含有部分代谢组学信息。主要偏重于代谢通路和整合代谢、基因和蛋白通路信息。目前还有372条代谢通路和超过15000个各类代谢产物（动物、植物和细菌等）。