合成生物学培训课件.ppt

3. 代谢途径的快速进化 基因突变 改造代谢途径 生产目标化合物 Church 对20种番茄红素合成有关的基因进行突变； 将突变的90个DNA片段，转入大肠杆菌； 3天内产生了150亿基因突变体； 从中筛选到使番茄红素产量提高5倍的基因。 4. 利用合成生物学生产新能源 Kaslling利用13个可逆的酶促反应组合起来创建一条非天然的催化路径。 淀粉 + 水 H2 最小基因组与合成生物学 合成生物学最终目标： 合成独立的可遗传的人工生命体 人工生命的基本要素 具有膜系统 能进行新陈代谢 具有自己的基因 研究最简化生命的两种方法 从下而上：从核苷酸合成新生命体。 从上而下：从基因组中剔除非必要基因组。 1.人工构建合成生命体 2002年 Wimmer小组脊髓灰质炎病毒的合成 Venter 合成噬菌体基因组和生殖道支原体基因组 三个步骤：合成、组装和移植 合成 ： 蕈状支原体的基因组是一条大片段的DNA分子，序列是A、T、G、C四种脱氧核糖核苷酸的排列组合。 通过实验确定维持其生命周期的最小基因组，并加上4个“水印基因”作为标记。 用计算机精确计算需要合成DNA分子序列，并用化学方法合成A、T、G、C碱基，并使其按所要求序列延伸。 这是它被称为“人造生命”或者“化学合成”的关键。 Venter用化学方法合成了一千多个约1kb的DNA片段，作为这次组装的基本材料。 Venter的实验 组装： 因为合成生物学技术上的局限，不能直接合成上万碱基对的DNA大分子，所以Venter等人巧妙地借助啤酒酵母和大肠杆菌的帮助，把1Kb的DNA分子有序准确的连成超过1000kb的片段。 移植： Venter等把这个合成基因组移植到不含限制性酶切系统的山羊支原体中，基因组能使用后者的酶系统进行自我复制，经过多代繁殖后，长成的菌落已经纯粹由蕈状支原体组成。 丝状支原体 《用化学合成的基因组构建一个细菌细胞》 2. 最小基因组的构建 Blattnerj小组删除大肠杆菌基因组的15%（高达82Kb）, 细菌仍保持了良好的生存状态。 改造后菌株的电穿孔效率、基因表达都有改变。 最小基因组优点 选择性的保留所需的代谢途径和功能； 成为合成基因网络理想的容器； 为插入模块提高最简单无干扰的环境。 理想的细胞底盘应具备的条件 长期培养中保持基因稳定 能够在低营养培养基中生长以降低成本 同时协调多基因的表达 能够通过调整合成路径抑制与生产无关的合成路径 15.3.4 构建多细胞体系 多细胞体系是建立在群体细胞效应的研究基础上，多细胞涉及细胞间的通信体系。 群体效应：微生物通过自身产生的一种化学信号来感受群体的浓度，从而表现出某种特殊的行为。 细菌QS系统作用 细菌根据特定信号分子的浓度可以监测周围环境中自身或其它细菌的数量变化，当信号达到一定的浓度阈值时，能启动菌体中相关基因的表达来适应环境中的变化。 枯草芽胞杆菌利用QS系统对细胞的发育进行调控 当营养丰富、菌体稀少时向感受态方向发展； 营养贫乏菌体密度高时向芽胞方向发展。 15.4 展望 2004年合成生物学被美国MIT出版的《技术评论》评为“将改变世界的10大新技术之一”。 美国生物经济研究协会2007年发表了题为《基因组合成和设计未来：对美国经济的影响》的研究报告。 细菌能估计刺激物的距离，并根据距离的改变做出反应。 该项研究可用来探测地雷位置： 靠近地雷时细菌发绿光； 远离地雷时则发红光。 麻省理工学院计算机工程师 Thank You! * * * LOGO 合 成 生 物 学简 介 内 容 1. 合成生物学的概念 2. 研究方式和工具 3. 合成生物学的研究方向 合成生物学(synthetic biology) 基于系统生物学的遗传工程和工程方法的人工生物系统研究，从基因片段、DNA分子、基因调控网络与信号传导路径到细胞的人工设计与合成，类似于现代集成型建筑工程，将工程学原理与方法应用于遗传工程与细胞工程等生物技术领域，合成生物学、计算生物学与化学生物学一同构成系统生物技术的方法基础。 目的在于设计和创造新的生物组件和体系，对现有的生物体系进行重新设计。从基本的生物组件构建复杂的人工生命体系