大规模基因组测序中的信息分析教材幻灯片.pptVIP

大规模基因组测序中的信息分析--拼接与注释 大规模测序是基因组研究的最基本任务，它的每一个环节都与信息分析紧密相关。从测序仪的光密度采样与分析、碱基读出、载体标识与去除、拼接与组装、填补序列间隙、到重复序列标识、读框预测和基因标注的每一步都是紧密依赖基因组信息学的软件和数据库的。 ;;Sequence Data Distribution; How to find the coding regions in  rude DNA sequence?;;Neural Network Procedure;If neuron j is in the output layer (i.e.,l=L), set ;-------------??;;Fractal Dimension of Exon and Intron Sequences;Using the methods and techniques in cryptology ;Coincident index;COINCIDENT INDEX OF EXON AND INTRON;The Values of Coincident Index in HSHSC70 Sequence;ORF Prediction of the Contig by 5 Method;Composite Artificial Neural Network System;Auto-annotation Procedure;;A. T. tengcongensis Complete Genome Analysis;大规模全基因组shotgun测序 Shotgun 反应: 109,970 有效总读长???26,553,803bp 基因组总长：2,689,445bp 冗余度：9.87× PCR补洞 PCR反应：40,000 PCR产物测序：4,100;Circular representation of the genome of T. tengcongensis MB4; 谢谢各位!;多种 ?? 肺炎 细菌均可引起大叶性肺炎，但绝大多数为肺炎链球菌，其中以Ⅲ型致病力最强。肺炎链球菌为革兰阳性球菌，有荚膜，其致病力是由于高分子多糖体的荚膜对组织的侵袭作用。少数为肺炎杆菌、金黄*色葡萄球菌、溶血性链球菌、流感嗜血杆菌等。肺炎链球菌为口腔及鼻咽部的正常寄生菌群，若呼吸道的排菌自净功能及机体的抵抗力正常时，不引发肺炎。当机体受寒、过度疲劳、醉酒、感冒、糖尿病、免疫功能低下等使呼吸道防御功能被削弱，细菌侵入肺泡通过变态反应使肺泡壁毛细血管通透性增强，浆液及纤维素渗出，富含蛋白的渗出物中细菌迅速繁殖，并通过肺泡间孔或呼吸细支气管向邻近肺组织蔓延，波及一个肺段或整个肺叶。大叶间的蔓延系带菌的渗出液经叶支气管播散所致。 编辑本段临床表现 　　多数起病急骤，常有受凉淋雨、劳累、病毒感染等诱因，约1/3患病前有上呼吸道感染。病程7~10天。 　　（一）寒战、高热：典型病例以突然寒战起病，继之高热，体温可高达39℃~40℃，呈稽留热型，常伴有头痛、全身肌肉酸痛，食量减少。抗生素使用后热型可不典型，年老体弱者可仅有低热或不发热。