附录-药物生物信息学.pptVIP

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  • 2018-03-02 发布于河北
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附录-药物生物信息学

基于结构预测构象抗原表位实际预测一个具有明确功能的结构域,其利用小样本集已知抗原与单抗复合物的晶体结构数据建立识别方法,预测的准确性可大于70%,有对应的免费服务器可用。 B-淋巴细胞的构象抗原表位识别方法还不成熟,预测的结果需要仔细的实验验证过程,这也是当前生物信息学研究的热点领域之一。 二、蛋白质的免疫原性预测 B-淋巴细胞的连续抗原表位 据抗原肽处理和识别对象的差异,T细胞的抗原表位分成细胞毒性T细胞 (cytotoxic T lymphocyte, CTL ) 抗原表位和辅助性T细胞抗原表位。CTL抗原表位和MHC I形成复合物。 预测此类抗原表位主要有两类策略,第一类基于抗原表位肽与MHC I结合特性,第二类基于抗原表位肽被加工处理的过程进行预测。 二、蛋白质的免疫原性预测 B-淋巴细胞的连续抗原表位 人MHC I和b-2巨球蛋白、HIV 包膜糖蛋白120的可变肽段的复合物 (3E6H.pdb) 二、蛋白质的免疫原性预测 B-淋巴细胞的连续抗原表位 与MHC II结合的T-淋巴细胞抗原表位主要是胞外的蛋白被吞噬形成吞噬小泡后进入溶酶体被部分水解所得肽段。MHC II与MHC I有类似的结构域结合抗原表位肽,但是来自两条链,且可结合的抗原表位肽段长度比MHC I可结

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