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分子生物学 绪论 一、学科定义 分子生物学是在分子水平研究生物结构和功能，研究生命现象的物质基础和揭示生命过程的基本活动规律的学科。主要是指遗传、生殖、生长和发育等生命基本特征的分子机理的阐明，从而为利用和改造生物奠定理论基础和提供新的手段。 二、研究对象、主要内容 1． 对象：从广义的讲：蛋白质及核酸等所有生物大分子结构和功能的研究都属于分子生物学的范畴。 2． 主要内容 我们学习的基础分子生物学主要包括以下内容： DNA、染色体及基因组（分子生物学的物质基础） DNA的复制与修复（遗传信息的世代传递，确保其精确的机制） 基因重组（生物变异与进化） RNA的生物合成（遗传信息传递中的转录过程，转录后的加工） 蛋白质的生物合成（遗传信息传递中的翻译过程，遗传密码子） 基因表达调控（基因的时序表达；3～4万个蛋白质编码基因是否意味着只有3万种蛋白质） DNA操作技术（分子生物学发展的基础、工具) 三、发展简史 1．理论基础阶段 分子生物学是一门深层的理论与实验科学，它必须在自然科学发展到一定的深度后才逐渐形成。尤其得益于细胞学、遗传学和生物化学的发展。 2．形成发展阶段 由于核酸化学的发展，1953年美国科学家Watson和英国科学家Crick在前人的基础上（Chargaff, Wilkins及Franklin等），提出了DNA的双螺旋结构模型，为充分揭示遗传信息的传递规律铺平了道路（即本课程中第二章的基础）。 分子生物学的研究对生命科学的发展起着巨大的推动作用，受到国际科学界的高度重视，据统计从1910年到2001年，约50多人次科学家荣获诺贝尔化学奖及生理医学奖。 3．未来发展阶段 就基因组研究来说，它遵循的基本思路是：基因组→转录组→蛋白质组。 四、分子生物学在生命科学中的位置 1．分子生物学是从生物化学发展出来的一门科学。 2．分子生物学与微生物关系密切，曾认为分子生物学主要是E.coli的分子生物学。 3．与遗传学的关系，均涉及到遗传信息的载体及传递过程，为相辅相成的学科。 这些学科的关系，再一次证明了学科交叉是当代科学研究的特征与要求。 分子生物学的三大原则 ★ 构成生物大分子的单体是相同的 ★ 生物遗传信息的表达的中心法则相同 第一章 DNA、基因组及染色体 主要内容：进一步了解DNA的高级结构——超螺旋的相关知识，解释拓扑异构现象；学习染色体的组成及构造层次；学习基因概念，基因组的大小、复杂性，以及原核与真核生物基因组的区别。 §1-1 DNA超螺旋及拓扑异构现象 一、超螺旋（superhelix or supercoil） 共价封闭环（covalently closed circle, 简称cccDNA 分子）： 超螺旋：指双螺旋环状分子再度螺旋化即成为超螺旋结构。 二、超螺旋的方向性（正超螺旋与负超螺旋） 1．松弛（relaxed）状态（双螺旋轴没有“净弯曲缠绕”）：DNA在水溶液中, 构型偏B型状态。DNA以10.5 bp/helix为最稳定构型。 2．正超螺旋：小于10.5bp/helix，则其二级结构处于紧缩状态，由此产生的超螺旋为正超螺旋。 3．负超螺旋：大于10.5bp/helix，则其二级结构处于松缠状态，由此产生的超螺旋为负超螺旋。 三、DNA超螺旋的拓扑学定义（1969年 White等） 1． 数学式描述DNA超螺旋： Lk = Tw + Wr Lk：链环数，Tw：缠绕数，Wr：扭曲数。 Lk具有拓扑性质。如果闭合环形DNA分子的任意一条链上有切口，Lk值就不确定了。 例题：见教材P84～85。 2．比连系差（Specific linking difference）σ 3．DNA超螺旋的生物学意义 超螺旋DNA具有更紧密地形状，因此在DNA组装中具有重要作用； DNA的结构具有动态性，DNA超螺旋程度的改变介导了这种结构的变化，这有利于其功能的发挥。 3. DNA是一种热力学上的稳定结构，超螺旋的引入提高了它的能量水平。 四、DNA的拓扑异构体（topoisomer） 1．DNA的拓扑异构体；具有不同连接数的同一种DNA分子称为DNA的拓扑异构体。即在保持DNA一级和二级结构不变的情况下，两条单链可以相互缠绕，形成不同的空间构型。 2. DNA拓扑异构酶：细胞内存在着一类能催化DNA拓扑异构体相互转化的酶称为～。 3. 其他影响因素 §1-2 基因和基因组 一、基因相关概念 1.基因(gene)：：产生一条多肽链或功能RNA所必需的全部核苷酸序列，在遗传学上也称顺反子。 基因家族：真核生物的基因组中有许多来源相同，结构相识，功能相关的基因称为基因家族。一个基因家族的不同成员常编码有相似但不完全相同氨基酸序列的蛋白质，每个成员的表达水平也可不同。据估计，高等植物中有20 000～30 00