中国牛亚科家畜犌犎基因编码区序列的遗传变异研究-畜牧兽医学报.PDFVIP

畜牧兽医学报 ， （ ）： １７７９１７８４ 　 犃犮狋犪犞犲狋犲狉犻狀犪狉犻犪犲狋犣狅狅狋犲犮犺狀犻犮犪犛犻狀犻犮犪 中国牛亚科家畜犌犎基因编码区序列的遗传变异研究 ， １２ ２ ２ ２ ２ １ ２ 耿荣庆 ，常 洪 ，李永红 ，冀德君 ，常春芳 ，王兰萍 ，常国斌 　 （ 盐城师范学院生命科学与技术学院，盐城 ； 扬州大学动物科学与技术学院，扬州 ） １． ２２４０５１２． ２２５００９ 摘 要：采用 产物直接双向测序法，分段扩增普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛和亚洲水牛共 个牛种的 基因， ＰＣＲ ５ 犌犎 　 并拼接成编码区全序列，分析中国牛亚科家畜不同牛种犌犎基因编码区序列变异及其分子进化特征。结果表明， 牛 基因编码区序列全长 ，种间核苷酸突变率在 。 个牛种编码区序列定义了 种单倍 犌犎 ６５４ｂ ０．１％ １．８４％ ５ １０ ｐ ～ 型，瘤牛的单倍型多样性最高，大额牛和水牛均无单倍型多样性。 基因编码区序列的密码子使用存在偏倚性， 犌犎 共发现了 个偏好性密码子。核苷酸的替代以转换为主，转换明显高于颠换，转换／颠换比为 。非同义突变位 ２５ ３．０ 点远远少于同义突变位点，同义与非同义替代发生的速率比都小于或等于 ，表明 基因编码区序列不受达尔文 １ 犌犎 正选择的影响。以犌犎基因单倍型序列为基础的分子进化树表明，水牛与普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛间分化很明 显；普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛间序列分化并不明显，并且它们共同拥有一条相同的祖先核苷酸序列。说明中国牛 亚科家畜犌犎基因编码区序列的变异相当贫乏，并且由于功能的约束表现得相当保守，进化速率相当缓慢。 关键词：牛亚科；生长激素基因；编码区序列；分子进化 中图分类号： 文献标识码： 文章编号： （ ） Ｓ８２３．２ Ａ ０３６６６９６４２００８１２１７７９０６ 　　　　 　　　　 犞犪狉犻犪狋犻狅狀狅犳犆狅犿 犾犲狋犲犆狅犱犻狀 犛犲狌犲狀犮犲狅犳犌犎犌犲狀犲犻狀犆犺犻狀犲狊犲犅狅狏犻狀犪犲犛犲犮犻犲狊 狆 犵 狇 狆 ， １２ ２ ２ ２ ， ， ， ， ＧＥＮＧＲｏｎｉｎ ＣＨＡＮＧＨｏｎ ＬＩＹｏｎｈｏｎ ＪＩＤｅｕｎ ｇｑ ｇ ｇ ｇ ｇ ｊ