罗氏将推出最新EMPCR自动化富集方案.doc

罗氏将推出最新EMPCR自动化富集方案 最近，一个新的罗氏 454测序emPCR自动化富集方案成功地在Hamilton MICROLAB　STARlet自动化移液平台上得以实现。这一实验方法利用罗氏的REM e移液系统，一次实验可以处理多达八个样本的乳液PCR产物磁珠法富集，并完成测序引物退火，直接衔接在罗氏454 GS FLX的测序实验。这一综合性的自动化系统一步完成了多个富集步骤，减少人为操作可引起的误差，使得实验结果稳定，并大大缩短实验时间。 454测序需要对制备的文库进行乳液PCR，对包含单克隆序列的测序珠进行扩增，其后需要分解改乳液体系，并对体系中的测序珠进行洗涤以及富集。在洗涤及富集过程中，需要进行反复的移液、离心、颠倒试管、磁力吸附等操作。这一自动化解决方案即替代了这一人工操作过程，只需少量的设置程序以及放置试管试剂的步骤就可以在无人情况下完成所有步骤，节省约五个小时左右的人工操作。单次自动化实验也只需3.5小时左右，相比人工实验，节省了测序实验的总时间。 一共有五种不同的自动化实验设计，配合不同的样本数量及体积。在Hamilton STARlet自动化移液台上，可以准确设定罗氏REM e系统位置，以及其配套试管架的位置，实验所需放置的试管及试剂的种类和数量也在新的实验手册中进行了详细描述。罗氏的REM e系统可以进行震荡、真空抽滤、磁珠捕获及加热等实验操作。Hamilton STARlet移液平台通过1000微升的独立移液系统移动液体。 罗氏454公司将进一步与该自动化移液平台公司合作开发配合GS Junior系统的自动化解决方案， 可在Hamilton的STAR系列及NIMBUS系列自动化移液平台上实现。小型的NIMBUS工作站与GS Junior台式测序仪结合，使得测序总量较小的客户能够获得完整而低资金投入的自动化解决方案。 此外，除了上述自动化移液平台外，罗氏的REM e系统也可以装载在其他移液平台上如Biomek及Tecan系列平台等。 肿瘤个人化治疗是肿瘤治疗的发展方向，比如使用单克隆抗体，抑制一些蛋白的促肿瘤生长作用。全面而准确评估患者的肿瘤基因背景，是抗体治疗成功的关键。目前这种治疗只针对少数的肿瘤相关基因区域，而使用二代测序仪GS Junior系统能够经济、有效地获得所有这些相关基因的序列信息。与此相比，传统毛细管电泳测序方法，检测灵敏度较低，价格相对较高，尤其是对于肿瘤突变小于20%的情况。 二代测序技术将对肿瘤个人化治疗起到重要作用。GS Junior能够获得肿瘤组织的混合细胞中各种基因突变信息，无论是已知的还是新型的突变。此外，GS Junior在分析复杂的肿瘤样本方面的优势在于它的长读长特点，在可以灵敏检测低频率的体细胞突变的同时，又可以判定各种类型的肿瘤突变，包括大片段的结构变异。 Roche′s GS Junior Sequencing System used in research on personalized tumor treatment Individual tumor treatment success largely depends on the mutation status of tumor genes. Roche抯 GS Junior Sequencing system is now used for a sequencing approach that has great potential for personalized medicine: the Center for Human Genetics and Laboratory Medicine Dr. Klein and Dr. Rost, and IMGM Laboratories, both located in Martinsried, Germany, reported using the Roche GS Junior Benchtop System to sequence clinically relevant protein coding DNA (exons) and identify genomic variations in solid tumors treated with an antibody-based medicine. Personalized tumor treatments, such as monoclonal antibodies (mAb) that specifically target tumor-inducing proteins, require a precise and comprehensive assessment of an individu